180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0299 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0299  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  916    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.251177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0680  hypothetical protein  43.74 
 
 		 451 aa  338  8e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0908  hypothetical protein  43.24 
 
 		 451 aa  329  8e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2055  hypothetical protein  42.45 
 
 		 442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0371  hypothetical protein  34.73 
 
 		 457 aa  253  6e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.294814  normal  0.553229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0669  hypothetical protein  34.62 
 
 		 439 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0418  membrane-fusion protein  31.17 
 
 		 436 aa  245  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0478  hypothetical protein  31.38 
 
 		 436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0146  hypothetical protein  31.71 
 
 		 439 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1673  hypothetical protein  31.19 
 
 		 446 aa  234  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27195  normal  0.595527 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5410  hypothetical protein  32.74 
 
 		 449 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.288703  normal  0.36048 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3181  hypothetical protein  30.91 
 
 		 446 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3740  HlyD family secretion protein  33.33 
 
 		 441 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3073  hypothetical protein  31.63 
 
 		 448 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0389  hypothetical protein  31.61 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.478293  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0473  hypothetical protein  31.08 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.796891  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0568  hypothetical protein  31.53 
 
 		 442 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1154  hypothetical protein  31.15 
 
 		 490 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0926  GAF domain-containing protein  23.74 
 
 		 614 aa  75.1  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1408  membrane-fusion protein-like  25.69 
 
 		 631 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.382309  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3968  hypothetical protein  25.09 
 
 		 727 aa  70.1  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0475594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2199  membrane-fusion protein-like protein  25.97 
 
 		 619 aa  66.6  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291447 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002593  membrane-fusion protein  27.92 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00429247  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  27.88 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0139  secretion protein HlyD  32.03 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2177  GAF domain-containing protein  22.95 
 
 		 611 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266529 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0225  secretion protein HlyD  28.9 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34961  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03415  hypothetical protein  26.06 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3236  GAF domain-containing protein  22.51 
 
 		 578 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.07 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2359  putative phytochrome sensor protein  21.03 
 
 		 627 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3208  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.26 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0146448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1325  RND family efflux transporter MFP subunit  23.6 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.784041  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0110  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.48 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0109  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.48 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  25 
 
 		 400 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0909  hypothetical protein  27.71 
 
 		 709 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 430 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3362  RND family efflux transporter MFP subunit  27.71 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1080  MacA  23.21 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2056  hypothetical protein  25.78 
 
 		 709 aa  54.7  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0247  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.9 
 
 		 380 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2570  hypothetical protein  22.47 
 
 		 370 aa  53.9  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295981  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0157  hypothetical protein  27.46 
 
 		 366 aa  53.1  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  27.14 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0681  hypothetical protein  28.37 
 
 		 709 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2400  GAF domain-containing protein  23.21 
 
 		 628 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3278  hypothetical protein  22.18 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.19 
 
 		 380 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0758  macrolide-specific efflux protein MacA  25.76 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0225012  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3180  peptidase M50  29.35 
 
 		 688 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1418  RND family efflux transporter MFP subunit  31.37 
 
 		 384 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.267918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21021  leukotoxin secretion protein-like protein  22.62 
 
 		 376 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.825476 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0236  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.49 
 
 		 379 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.94922  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3112  RND family efflux transporter MFP subunit  24.67 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0618  putative phytochrome sensor protein  21.89 
 
 		 615 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.24 
 
 		 360 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2000  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.24 
 
 		 360 aa  51.2  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.461729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3234  hypothetical protein  26.78 
 
 		 309 aa  50.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475662  normal  0.284484 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.56 
 
 		 354 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0673  multidrug resistance protein  24.32 
 
 		 354 aa  50.4  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05965  hypothetical protein  34.82 
 
 		 357 aa  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  26.04 
 
 		 358 aa  50.1  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  28 
 
 		 370 aa  50.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.04 
 
 		 358 aa  50.1  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  24.86 
 
 		 484 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7850  HlyD family secretion protein  25.82 
 
 		 334 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0800045  normal  0.246605 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1310  secretion protein HlyD  28.41 
 
 		 379 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.673983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  28.08 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  28.08 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  26.63 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  28.08 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  26.63 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2738  membrane-fusion protein  22 
 
 		 399 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.63 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03980  HlyD family secretion protein  28.57 
 
 		 297 aa  48.9  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79966  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  26.87 
 
 		 369 aa  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.22 
 
 		 403 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000105  membrane-fusion protein  27.71 
 
 		 351 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.860226  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0221  RND family efflux transporter MFP subunit  24.87 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.514226  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  26.87 
 
 		 361 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  25 
 
 		 354 aa  47.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1668  secretion protein HlyD  40.68 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.223118  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1510  secretion protein HlyD  26.38 
 
 		 357 aa  47.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  25.97 
 
 		 354 aa  48.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  27.62 
 
 		 351 aa  47.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000228  membrane-fusion protein  27.47 
 
 		 357 aa  47.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  27.72 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  25.54 
 
 		 370 aa  47.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02529  putative multidrug resistance protein (substrate binding lipoprotein)  30.33 
 
 		 403 aa  47.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0679  hypothetical protein  22.64 
 
 		 251 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2952  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.54 
 
 		 374 aa  47.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0067  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.45 
 
 		 453 aa  47.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0706  secretion protein HlyD  20.49 
 
 		 366 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000331728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3608  secretion protein HlyD  26.83 
 
 		 400 aa  47.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221607  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1296  RND family efflux transporter MFP subunit  24.83 
 
 		 373 aa  47.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00794293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  24.26 
 
 		 390 aa  47.4  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1312  RND family efflux transporter MFP subunit  24.56 
 
 		 371 aa  47  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  26.37 
 
 		 403 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1839  membrane-fusion protein  25.66 
 
 		 388 aa  47  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00691456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>