179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0833 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0833  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 
257 aa  531  1e-150  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1772  chymotrypsin serine protease  83.33 
 
 
259 aa  447  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00326705 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0164  chymotrypsin serine protease  82.42 
 
 
257 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00504821  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0142  chymotrypsin serine protease  83.4 
 
 
260 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126244  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1770  chymotrypsin serine protease  66.15 
 
 
260 aa  358  4e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00353652 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0140  chymotrypsin serine protease  61.54 
 
 
261 aa  327  9e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2247  peptidase S1C, Do  33.13 
 
 
497 aa  62.4  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  31.36 
 
 
491 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  32.18 
 
 
523 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  30.46 
 
 
526 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  33.73 
 
 
523 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  31.9 
 
 
502 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  29.59 
 
 
516 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  30.36 
 
 
527 aa  56.6  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  30.36 
 
 
520 aa  55.8  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  32.22 
 
 
464 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  30 
 
 
528 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  30.67 
 
 
504 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  30.81 
 
 
525 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  29.52 
 
 
528 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  29.76 
 
 
527 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  30.59 
 
 
513 aa  53.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  30.59 
 
 
513 aa  53.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  29.45 
 
 
537 aa  52.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4410  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.27 
 
 
584 aa  52  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  29.07 
 
 
520 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3947  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.67 
 
 
541 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.889809  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  30.12 
 
 
527 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  30.54 
 
 
517 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  26.04 
 
 
471 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  28.99 
 
 
483 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  30.49 
 
 
505 aa  50.4  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  28.99 
 
 
483 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  29.45 
 
 
503 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.66 
 
 
544 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  29.45 
 
 
496 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  29.45 
 
 
503 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  29.45 
 
 
501 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  29.63 
 
 
496 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  28.41 
 
 
509 aa  50.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  27.98 
 
 
483 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  27.38 
 
 
461 aa  49.3  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  26.34 
 
 
471 aa  48.9  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  28.4 
 
 
458 aa  48.9  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  28.4 
 
 
457 aa  48.9  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  30.11 
 
 
473 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2684  2-alkenal reductase  28.57 
 
 
391 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0386  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.32 
 
 
484 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  32.93 
 
 
522 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  29.51 
 
 
502 aa  48.5  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.65 
 
 
379 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0414  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.32 
 
 
481 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2807  HtrA2 peptidase  28.07 
 
 
308 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  28.65 
 
 
379 aa  48.1  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1343  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  27.78 
 
 
536 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.937553  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  25.3 
 
 
472 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  27.86 
 
 
475 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  28.05 
 
 
506 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  27.22 
 
 
476 aa  47.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1324  2-alkenal reductase  27.71 
 
 
469 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  25.13 
 
 
365 aa  47.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0415  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.32 
 
 
483 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0855  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.54 
 
 
301 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  26.51 
 
 
511 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0712  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.43 
 
 
426 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.482576 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  30.41 
 
 
392 aa  47  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  27.11 
 
 
471 aa  47  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0659  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.01 
 
 
428 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.397901  hitchhiker  0.00328484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  28.22 
 
 
508 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3731  protease DO  27.54 
 
 
476 aa  46.6  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.233243  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0904  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.67 
 
 
301 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313384  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  27.43 
 
 
476 aa  46.6  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  29.01 
 
 
496 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  27.43 
 
 
490 aa  46.2  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  31.14 
 
 
523 aa  46.2  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  27.22 
 
 
518 aa  46.2  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0900  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.67 
 
 
301 aa  46.2  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.38111  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  29.59 
 
 
510 aa  45.8  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  26.51 
 
 
388 aa  45.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  24.1 
 
 
476 aa  46.2  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  27.54 
 
 
491 aa  45.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  26.18 
 
 
492 aa  45.8  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0274  protease Do  28.05 
 
 
509 aa  45.8  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.408213 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  24.6 
 
 
462 aa  45.4  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1068  serine protease, DegP/HtrA family  27.41 
 
 
394 aa  45.4  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1719  HtrA2 peptidase  27.75 
 
 
233 aa  45.4  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  27.62 
 
 
504 aa  45.4  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0705  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.17 
 
 
439 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4138  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.55 
 
 
752 aa  45.4  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0248292 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  26.06 
 
 
472 aa  45.4  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  27.07 
 
 
505 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  24.4 
 
 
476 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  27.17 
 
 
501 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  24.4 
 
 
476 aa  45.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  28.49 
 
 
511 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0912  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.87 
 
 
303 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000212061  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1649  protease Do  32.11 
 
 
474 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0827513 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  26.34 
 
 
485 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1146  2-alkenal reductase  25.68 
 
 
374 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  26.67 
 
 
467 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>