More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1068 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1285  serine protease  92.64 
 
 
394 aa  690    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000207933  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1096  2-alkenal reductase  87.79 
 
 
394 aa  674    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000450263  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1068  serine protease, DegP/HtrA family  100 
 
 
394 aa  796    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  37.75 
 
 
395 aa  194  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1216  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.7 
 
 
401 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  37.76 
 
 
397 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  42.03 
 
 
475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  39.64 
 
 
453 aa  182  9.000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.22 
 
 
386 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  35.46 
 
 
389 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.31 
 
 
387 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.96 
 
 
384 aa  182  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0703  2-alkenal reductase  37.67 
 
 
425 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.09 
 
 
381 aa  182  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  40.29 
 
 
511 aa  178  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0594  2-alkenal reductase  36.41 
 
 
379 aa  178  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  37.28 
 
 
464 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  39.3 
 
 
368 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  38.01 
 
 
457 aa  176  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4610  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.45 
 
 
428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  39.51 
 
 
490 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7239  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.13 
 
 
569 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.108633  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  37.85 
 
 
453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  39.51 
 
 
476 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0365  protease Do  35.6 
 
 
459 aa  173  5e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0347  protease Do  35.6 
 
 
459 aa  173  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.342826  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  37.63 
 
 
506 aa  172  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  40.71 
 
 
411 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  39.65 
 
 
518 aa  171  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0393  HtrA2 peptidase  41.83 
 
 
397 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  39.42 
 
 
488 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0384  2-alkenal reductase  41.83 
 
 
383 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  38.73 
 
 
493 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  39.24 
 
 
385 aa  170  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.29 
 
 
410 aa  170  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  34.92 
 
 
474 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  35.22 
 
 
478 aa  170  5e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  37.37 
 
 
480 aa  170  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1158  HtrA2 peptidase  38.01 
 
 
408 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.201406  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  37.76 
 
 
412 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  37.15 
 
 
420 aa  169  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  38.57 
 
 
477 aa  169  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  38.57 
 
 
477 aa  169  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  39.58 
 
 
385 aa  169  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.78 
 
 
367 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  38.1 
 
 
491 aa  169  8e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2464  HtrA2 peptidase  37.37 
 
 
415 aa  169  9e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1127  2-alkenal reductase  37.67 
 
 
408 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  37.73 
 
 
487 aa  169  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  39.35 
 
 
471 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  36.59 
 
 
472 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  39.72 
 
 
495 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  37.86 
 
 
452 aa  168  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3025  2-alkenal reductase  37.76 
 
 
413 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0951822  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  37.77 
 
 
464 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  33.9 
 
 
402 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  39.71 
 
 
450 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  37.85 
 
 
476 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0752  2-alkenal reductase  35.71 
 
 
372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0327336 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  37.97 
 
 
483 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2513  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.94 
 
 
392 aa  167  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1719  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.11 
 
 
374 aa  167  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000748788  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
375 aa  167  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  38.46 
 
 
493 aa  167  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  37.27 
 
 
466 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2676  HtrA2 peptidase  39.43 
 
 
351 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0673345 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2174  protease Do  38.87 
 
 
490 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.281026 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  36.77 
 
 
513 aa  166  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  37.29 
 
 
483 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  37.29 
 
 
483 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  38.63 
 
 
505 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  40.15 
 
 
509 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  39.18 
 
 
476 aa  166  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1006  protease Do  37.54 
 
 
499 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.836835  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1010  protease Do  37.54 
 
 
499 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.644369  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  38.16 
 
 
485 aa  166  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2024  peptidase S1C, Do  38.49 
 
 
473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.115837  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5265  protease Do  38.41 
 
 
498 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3714  2-alkenal reductase  36.57 
 
 
389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00887093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  37.59 
 
 
411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  38.01 
 
 
504 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  36.93 
 
 
497 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12778  serine protease precursor  36.11 
 
 
467 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  37.54 
 
 
500 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  39.19 
 
 
469 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  37.68 
 
 
473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  39.85 
 
 
461 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  36.28 
 
 
389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  38.46 
 
 
511 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  37.64 
 
 
458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0919  2-alkenal reductase  37.01 
 
 
377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000486689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3404  2-alkenal reductase  35.91 
 
 
404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000199596  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  37.59 
 
 
516 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_002936  DET1037  serine protease  37.01 
 
 
373 aa  164  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0643787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  37.81 
 
 
502 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  38.85 
 
 
511 aa  164  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  37.81 
 
 
502 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  38.6 
 
 
485 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  40.43 
 
 
361 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  37.81 
 
 
502 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>