More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1343 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1343  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  100 
 
 		 536 aa  1091    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.937553  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  32.24 
 
 		 528 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  33.58 
 
 		 500 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0073  2-alkenal reductase  35.41 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0754695 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.07 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  30.91 
 
 		 527 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  32 
 
 		 473 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.98 
 
 		 380 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  33.33 
 
 		 498 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  30 
 
 		 526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  34.87 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  35.98 
 
 		 528 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  37.6 
 
 		 485 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  33.33 
 
 		 382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  33.68 
 
 		 506 aa  134  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  36.19 
 
 		 501 aa  134  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  30.97 
 
 		 478 aa  134  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.92 
 
 		 367 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0079  2-alkenal reductase  35.66 
 
 		 474 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0091  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.66 
 
 		 474 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000577253  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  29.73 
 
 		 508 aa  133  9e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  34.44 
 
 		 502 aa  133  9e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1398  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.22 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2158  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.01 
 
 		 507 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0489221  normal  0.0113989 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  35 
 
 		 516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  35.41 
 
 		 500 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  36.21 
 
 		 464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.35 
 
 		 417 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.05 
 
 		 544 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2079  HtrA2 peptidase  32.71 
 
 		 420 aa  131  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.376096  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  32.65 
 
 		 525 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  33.33 
 
 		 469 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  35.66 
 
 		 399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  34.7 
 
 		 391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.1 
 
 		 423 aa  130  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  35.77 
 
 		 483 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  35.77 
 
 		 483 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  35.77 
 
 		 495 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  35.77 
 
 		 495 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  35.77 
 
 		 495 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  35.77 
 
 		 483 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  38.14 
 
 		 477 aa  130  9.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  35.77 
 
 		 495 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  35.77 
 
 		 495 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  36.12 
 
 		 369 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  34.34 
 
 		 504 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  33.57 
 
 		 372 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0552  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.87 
 
 		 423 aa  129  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.35 
 
 		 394 aa  128  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  34.56 
 
 		 505 aa  128  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3965  protease Do  33.08 
 
 		 514 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.938465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.14 
 
 		 388 aa  127  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  33.33 
 
 		 386 aa  127  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  36.05 
 
 		 494 aa  127  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  36.78 
 
 		 499 aa  127  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  29.25 
 
 		 523 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  35.1 
 
 		 464 aa  127  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  35.21 
 
 		 491 aa  127  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  29.91 
 
 		 509 aa  127  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  33.58 
 
 		 491 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3217  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.5 
 
 		 387 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.557937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  30.11 
 
 		 466 aa  126  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  34.72 
 
 		 411 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0386  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.45 
 
 		 484 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  35.27 
 
 		 493 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  34.69 
 
 		 476 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  38.19 
 
 		 477 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  31.84 
 
 		 520 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  31.83 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  31.21 
 
 		 523 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  35.27 
 
 		 493 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  34.22 
 
 		 375 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  31.27 
 
 		 523 aa  125  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  35.27 
 
 		 493 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  31.4 
 
 		 504 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  33.09 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  35.68 
 
 		 473 aa  125  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  30.9 
 
 		 497 aa  125  3e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  37.8 
 
 		 479 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.16 
 
 		 405 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  35.74 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  35.66 
 
 		 494 aa  125  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  35.27 
 
 		 494 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  35.27 
 
 		 494 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  36.6 
 
 		 479 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  37.66 
 
 		 483 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  37.66 
 
 		 483 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  35 
 
 		 379 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0415  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.13 
 
 		 483 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.7 
 
 		 384 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  32.08 
 
 		 446 aa  124  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.72 
 
 		 379 aa  124  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  37.66 
 
 		 474 aa  124  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  30.87 
 
 		 524 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  33.47 
 
 		 476 aa  124  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  32.85 
 
 		 492 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  31.56 
 
 		 520 aa  124  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  32.85 
 
 		 492 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  32.68 
 
 		 476 aa  124  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  35.35 
 
 		 475 aa  123  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>