More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0143 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 310 aa  630  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  74.83 
 
 		 302 aa  438  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0287  polysaccharide deacetylase  69.18 
 
 		 277 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1517  polysaccharide deacetylase  67.63 
 
 		 301 aa  393  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0751328  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2403  polysaccharide deacetylase  66.18 
 
 		 279 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0664  polysaccharide deacetylase  64.86 
 
 		 291 aa  374  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0290858  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2524  polysaccharide deacetylase  64.1 
 
 		 281 aa  368  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0713961  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3276  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  63.41 
 
 		 279 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1981  polysaccharide deacetylase  60.81 
 
 		 283 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3114  polysaccharide deacetylase  58.13 
 
 		 305 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0588  polysaccharide deacetylase  58.7 
 
 		 282 aa  335  5.999999999999999e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  55.94 
 
 		 292 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1923  polysaccharide deacetylase  52.08 
 
 		 286 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2968  polysaccharide deacetylase  59.21 
 
 		 284 aa  305  7e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  54.36 
 
 		 299 aa  300  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  56.58 
 
 		 293 aa  299  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  51.47 
 
 		 281 aa  299  4e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2388  polysaccharide deacetylase  53 
 
 		 304 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  52.54 
 
 		 279 aa  293  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  52.54 
 
 		 279 aa  289  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  53.99 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1980  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  50.17 
 
 		 293 aa  281  8.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0139  FkbH  46.95 
 
 		 295 aa  278  8e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  51.45 
 
 		 293 aa  276  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02597  Polysaccharide deacetylase  47.19 
 
 		 270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14174  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  49.29 
 
 		 283 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  49.47 
 
 		 283 aa  272  6e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  50.91 
 
 		 298 aa  271  8.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  49.82 
 
 		 280 aa  259  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0835  polysaccharide deacetylase family protein  51.23 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2587  polysaccharide deacetylase  38.2 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784325  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2617  polysaccharide deacetylase  36.69 
 
 		 282 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  39.56 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  39.42 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3617  polysaccharide deacetylase  37.77 
 
 		 281 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000367499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0831  polysaccharide deacetylase  29.97 
 
 		 307 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00177779  normal  0.177326 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1104  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  31.56 
 
 		 289 aa  89  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  42.15 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  40.8 
 
 		 289 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  40.8 
 
 		 289 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  40.8 
 
 		 289 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  38.33 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  40 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0234  polysaccharide deacetylase  28.76 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  32.03 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  35.51 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  29.49 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  35.19 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  33.72 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  33.1 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  32.73 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  32.89 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  32.89 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  32.89 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  39.58 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  40.74 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  36.61 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  35.66 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  39.29 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  30.71 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  32.41 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  36.61 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0646  polysaccharide deacetylase  36.79 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  37.38 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07950  polysaccharide deacetylase  32.53 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  36.36 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  38.32 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  36.45 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  38.32 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 		 275 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  33.93 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  34.94 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  41.98 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 290 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  32.29 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  33.63 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  32.29 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  34.57 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  34.48 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  37.25 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  35.4 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  36.14 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  36.11 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  33.94 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>