125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0475 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0475  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  214  4e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  46.88 
 
 		 1694 aa  58.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  38.57 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  42.03 
 
 		 1276 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 562 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2796  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 621 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.669916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.71 
 
 		 730 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  34.25 
 
 		 573 aa  51.2  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1733  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.92 
 
 		 538 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.020269 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 213 aa  50.4  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  36.51 
 
 		 711 aa  49.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 927 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.43 
 
 		 707 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 1297 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  38.03 
 
 		 3560 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 3035 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 602 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  38.24 
 
 		 458 aa  49.3  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2672  TPR domain-containing protein  35.24 
 
 		 446 aa  48.5  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.306988  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  36.92 
 
 		 560 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 		 1069 aa  48.5  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  38.16 
 
 		 4079 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  36.62 
 
 		 543 aa  48.1  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 		 716 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 465 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  34.94 
 
 		 623 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 767 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0572  tetratricopeptide TPR_2  36.11 
 
 		 194 aa  47  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00850831  hitchhiker  0.0000040032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 836 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  35.14 
 
 		 576 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 244 aa  46.2  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 402 aa  47  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1387  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 333 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316988  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 512 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  33.85 
 
 		 564 aa  45.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  34.25 
 
 		 1486 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 		 4489 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2419  hypothetical protein  36.84 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.562404  normal  0.124361 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  35.29 
 
 		 398 aa  45.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 		 892 aa  45.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 409 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3866  TPR repeat protein  43.28 
 
 		 1677 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  39.29 
 
 		 1979 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 743 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 968 aa  45.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 667 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  35.9 
 
 		 626 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0304  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.05 
 
 		 646 aa  44.3  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.860081  normal  0.111747 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 573 aa  44.3  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 		 366 aa  44.3  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  37.74 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  39.06 
 
 		 247 aa  43.9  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0138  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000611488 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  32.58 
 
 		 887 aa  43.9  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0141  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 1737 aa  43.5  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  34.18 
 
 		 1013 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25.74 
 
 		 1007 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  39.34 
 
 		 508 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 452 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  38.67 
 
 		 377 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.68 
 
 		 363 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.85 
 
 		 784 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  37.74 
 
 		 292 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.51 
 
 		 565 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  31.65 
 
 		 620 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1192 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 1038 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1253  hypothetical protein  38.81 
 
 		 593 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.177752  unclonable  0.0000127054 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  33.33 
 
 		 331 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 207 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 329 aa  42  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 284 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 639 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 612 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  41.51 
 
 		 1094 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.68 
 
 		 363 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.61 
 
 		 296 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  29.79 
 
 		 566 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1138 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.18 
 
 		 397 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1276 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  36.26 
 
 		 713 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 243 aa  41.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  37.1 
 
 		 519 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  28.12 
 
 		 635 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0492  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 477 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.337722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 169 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0534  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 264 aa  41.6  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.120125  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4031  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.95 
 
 		 477 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.636683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 620 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 699 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  30.99 
 
 		 417 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 636 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  35.06 
 
 		 1221 aa  41.2  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.82 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3352  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 		 404 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000220615  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 466 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>