More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2419 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2419  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  363  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.562404  normal  0.124361 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  53.33 
 
 		 1694 aa  67.8  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  34.82 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  37.89 
 
 		 1276 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  46.48 
 
 		 243 aa  64.3  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  36.63 
 
 		 512 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  47.54 
 
 		 927 aa  63.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  39.24 
 
 		 4079 aa  61.2  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  38.98 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.93 
 
 		 784 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  38.57 
 
 		 573 aa  58.2  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3289  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.96 
 
 		 439 aa  57.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  31.71 
 
 		 1979 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  36.71 
 
 		 543 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  42.47 
 
 		 404 aa  57  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2834  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  35.96 
 
 		 439 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  33.33 
 
 		 623 aa  57  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  45 
 
 		 560 aa  56.6  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  36.76 
 
 		 730 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  43.75 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  38.98 
 
 		 4489 aa  55.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1000  TPR repeat-containing protein  32.81 
 
 		 486 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.326539  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  34.85 
 
 		 1013 aa  55.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 573 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  41.18 
 
 		 635 aa  55.1  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 562 aa  55.5  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  38.98 
 
 		 716 aa  55.1  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0489  TPR repeat-containing protein  44.07 
 
 		 618 aa  55.1  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0261011  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 836 aa  55.1  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 		 3560 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 608 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 711 aa  54.7  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  35.71 
 
 		 1007 aa  54.7  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 3035 aa  54.3  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 1094 aa  53.9  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 740 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.38 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  27.78 
 
 		 1067 aa  53.9  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  36.67 
 
 		 715 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 465 aa  53.9  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  30.68 
 
 		 2401 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2379  hypothetical protein  29.57 
 
 		 283 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  45.1 
 
 		 123 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  40 
 
 		 452 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1320  TPR repeat-containing protein  40.98 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000153469  hitchhiker  2.74516e-22 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  41.18 
 
 		 458 aa  53.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 		 366 aa  53.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  40.85 
 
 		 576 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  45.1 
 
 		 123 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  35.23 
 
 		 135 aa  52.4  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 344 aa  52.4  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 425 aa  52  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1733  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.34 
 
 		 538 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.020269 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  38.98 
 
 		 1049 aa  52.4  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 		 1827 aa  52  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0216  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 296 aa  52  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 		 602 aa  51.6  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  35.48 
 
 		 519 aa  51.6  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.35 
 
 		 296 aa  51.2  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 243 aa  51.2  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  42.11 
 
 		 375 aa  51.2  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  35.59 
 
 		 743 aa  50.8  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.33 
 
 		 707 aa  50.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  30.88 
 
 		 417 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.35 
 
 		 297 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 467 aa  50.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  36.07 
 
 		 252 aa  50.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2755  TPR repeat-containing protein  38.24 
 
 		 234 aa  50.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  39.68 
 
 		 393 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.35 
 
 		 297 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  39.34 
 
 		 564 aa  50.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0740  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.773618 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 591 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  36.49 
 
 		 550 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  40 
 
 		 745 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1138 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 1192 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 699 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 761 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  27.05 
 
 		 331 aa  50.1  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 217 aa  48.9  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 391 aa  49.3  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  34.38 
 
 		 391 aa  48.9  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  39.66 
 
 		 356 aa  48.9  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1399  TPR repeat-containing protein  36.76 
 
 		 450 aa  48.9  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0214  tetratricopeptide repeat domain protein  40.38 
 
 		 1004 aa  48.9  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467703  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 647 aa  48.9  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2057  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 127 aa  48.9  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.827411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  37.29 
 
 		 465 aa  48.5  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  38.33 
 
 		 314 aa  48.9  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>