254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3969 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3969  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 323 aa  655    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1603  GntR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 338 aa  305  9.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4672  GntR family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 343 aa  296  5e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1033  GntR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000187092  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0992  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1402  GntR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 341 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1750  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.271582  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5871  transcriptional regulator GntR family  40.91 
 
 		 332 aa  135  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3939  regulatory protein, GntR  29.1 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3370  GntR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 323 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130554  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4205  transcriptional regulator, GntR family  28.17 
 
 		 333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2086  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 358 aa  95.9  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701877 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1381  transcriptional regulator, GntR family  24.91 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1418  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1819  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 222 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.418734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2110  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 220 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 243 aa  55.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1663  GntR-like protein  28.7 
 
 		 218 aa  55.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2500  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 220 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0872238 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  22.61 
 
 		 215 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2840  transcriptional regulator, GntR family  22.94 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 206 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 241 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 240 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5454  transcriptional regulator, GntR family  47.27 
 
 		 245 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  24.64 
 
 		 227 aa  53.1  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 247 aa  52.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  47.27 
 
 		 245 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 249 aa  52.8  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  27.36 
 
 		 266 aa  52.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  45 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  26.63 
 
 		 230 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4258  GntR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 292 aa  51.2  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1408  GntR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3738  GntR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 237 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  27.14 
 
 		 232 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2025  GntR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 244 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 253 aa  50.4  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03369  Transcriptional regulator, GntR family protein  25.93 
 
 		 220 aa  50.4  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 232 aa  50.4  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4402  transcriptional regulator, GntR family  27.07 
 
 		 223 aa  50.1  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225327  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  26.02 
 
 		 219 aa  50.1  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2168  GntR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 237 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 222 aa  50.1  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0216  transcriptional regulator, GntR family  41.82 
 
 		 290 aa  50.1  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 231 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  26.32 
 
 		 223 aa  50.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  26.13 
 
 		 231 aa  49.7  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 231 aa  49.7  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 238 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 231 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1856  transcriptional regulator, GntR family protein  29.32 
 
 		 214 aa  49.3  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 268 aa  49.3  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 229 aa  49.3  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1375  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 243 aa  49.3  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0432264 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1958  GntR domain protein  27.85 
 
 		 340 aa  49.3  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 225 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  27.19 
 
 		 240 aa  49.3  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 238 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4588  GntR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  28.16 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 234 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4140  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 219 aa  48.9  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00242001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3698  GntR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0549783 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5719  transcriptional regulator, GntR family  26.18 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5870  transcriptional regulator, GntR family  24.08 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  40.58 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 238 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  40.58 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3621  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4949  GntR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427064  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0491  transcriptional regulator, GntR family  22.26 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0328606  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4902  GntR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 304 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.426963  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3640  transcriptional regulator, GntR family  24.08 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 252 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  25.98 
 
 		 240 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 229 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  37.31 
 
 		 228 aa  47.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 260 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2906  transcriptional regulator VanR  44.07 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.118956  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  43.1 
 
 		 223 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2145  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 254 aa  47.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5808  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 226 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432179  normal  0.582432 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  39.71 
 
 		 233 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 226 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  27.83 
 
 		 236 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 234 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>