91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0584 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  100 
 
 
321 aa  636    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  97.2 
 
 
321 aa  621  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  87.54 
 
 
317 aa  535  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  36.21 
 
 
341 aa  191  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  37.54 
 
 
339 aa  187  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  35.26 
 
 
344 aa  185  8e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  36.09 
 
 
312 aa  170  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  34.91 
 
 
1762 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  35.57 
 
 
318 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  36.81 
 
 
373 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  32.2 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  32.77 
 
 
812 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  31.27 
 
 
795 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  31.23 
 
 
1656 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  29.17 
 
 
445 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  32.73 
 
 
776 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  33.46 
 
 
1557 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  29.14 
 
 
990 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  30.51 
 
 
993 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  29.83 
 
 
314 aa  109  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  29.69 
 
 
321 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  32.79 
 
 
1017 aa  106  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  32.79 
 
 
1009 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  32.79 
 
 
1009 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  35.4 
 
 
454 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  29.19 
 
 
334 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  31.83 
 
 
693 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  30.33 
 
 
1461 aa  99.8  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  25.78 
 
 
497 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  28.37 
 
 
2942 aa  89.7  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  30.6 
 
 
471 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  31.58 
 
 
586 aa  86.3  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  29.43 
 
 
508 aa  84.3  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  30.64 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  29.53 
 
 
717 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  30.67 
 
 
642 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  28.4 
 
 
1514 aa  80.5  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  27.9 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 
461 aa  76.6  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6820  predicted protein  32 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.148371  hitchhiker  0.00500772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.91 
 
 
1453 aa  74.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  30.73 
 
 
1407 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  32.24 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  30.41 
 
 
336 aa  68.9  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  31.17 
 
 
646 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0386  kelch repeat-containing protein  28.33 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.73 
 
 
1451 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  25.34 
 
 
639 aa  65.9  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  29.02 
 
 
382 aa  65.1  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  43.48 
 
 
483 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3966  kelch domain-containing protein  24.77 
 
 
402 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  27.12 
 
 
605 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1887  Kelch repeat-containing protein  28.91 
 
 
358 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.445604 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32404  predicted protein  25.29 
 
 
494 aa  58.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  27.84 
 
 
368 aa  56.6  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  23.93 
 
 
377 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04564  Kelch-domain proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q703G6]  28.46 
 
 
1474 aa  54.7  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  29.78 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0025  kelch repeat-containing protein  25.2 
 
 
667 aa  54.3  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  29.07 
 
 
484 aa  52.8  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  29.52 
 
 
450 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2029  kelch repeat-containing protein  31.56 
 
 
514 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  34.13 
 
 
1744 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1613  Kelch repeat-containing protein  25.75 
 
 
280 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2580  Kelch repeat-containing protein  24.58 
 
 
557 aa  50.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  24.43 
 
 
725 aa  49.7  0.00006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  28.63 
 
 
448 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2528  kelch repeat-containing protein  29.34 
 
 
179 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1953  kelch repeat-containing protein  24.48 
 
 
460 aa  49.7  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0568  kelch repeat-containing protein  30.26 
 
 
396 aa  49.3  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.558625  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  26.89 
 
 
698 aa  49.3  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2467  cyclically-permuted mutatrotase family protein  22.79 
 
 
383 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000354773  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0984  kelch repeat-containing protein  26.7 
 
 
358 aa  48.9  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27233  predicted protein  24.54 
 
 
536 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27916  predicted protein  28.93 
 
 
577 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0545063 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29677  predicted protein  24.54 
 
 
536 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000968434 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03800  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  23.75 
 
 
465 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2527  kelch repeat-containing protein  27.01 
 
 
154 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0493  kelch repeat-containing protein  25.81 
 
 
376 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0451  kelch repeat-containing protein  24.01 
 
 
418 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42978  predicted protein  27.05 
 
 
632 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1960  two component regulator propeller domain-containing protein  26.07 
 
 
2374 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  27.4 
 
 
883 aa  46.2  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2941  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.05 
 
 
1215 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.972596  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND02740  conserved hypothetical protein  25.56 
 
 
1556 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9490  predicted protein  22.7 
 
 
506 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368235  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  35.09 
 
 
1222 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1683  kelch repeat-containing protein  23.12 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  27.74 
 
 
833 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1841  Kelch repeat-containing protein  19.78 
 
 
339 aa  43.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.958191 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2624  Kelch repeat-containing protein  25.67 
 
 
372 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0288564  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>