106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2028 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2028  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1285 aa  2612    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.628704  normal  0.0470638 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 		 649 aa  147  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 		 639 aa  140  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1130  TPR domain-containing protein  31.78 
 
 		 665 aa  132  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 1119 aa  120  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  24.15 
 
 		 2145 aa  119  5e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  21.94 
 
 		 782 aa  93.6  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  24.47 
 
 		 1611 aa  93.2  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1404 aa  90.5  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 		 1060 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  23.65 
 
 		 1328 aa  88.2  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.71 
 
 		 991 aa  88.2  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.32 
 
 		 828 aa  80.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  21.52 
 
 		 1507 aa  78.6  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  24.63 
 
 		 732 aa  77.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  24.3 
 
 		 578 aa  77.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.32 
 
 		 771 aa  75.1  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  23.25 
 
 		 1550 aa  72  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  24.25 
 
 		 825 aa  71.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  24.01 
 
 		 957 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 		 1215 aa  71.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 843 aa  69.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  20.45 
 
 		 807 aa  68.9  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.67 
 
 		 767 aa  68.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  25.6 
 
 		 725 aa  67.8  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7217  Tetratricopeptide TPR_4  22.19 
 
 		 994 aa  68.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  18.35 
 
 		 1261 aa  67.4  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 568 aa  65.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.99 
 
 		 568 aa  65.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  21.32 
 
 		 1581 aa  64.3  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1249  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 702 aa  64.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0879927  normal  0.272595 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1212 aa  64.7  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.79 
 
 		 991 aa  64.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.73 
 
 		 885 aa  63.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1123 aa  62  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  33.86 
 
 		 2413 aa  62  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  23.81 
 
 		 1288 aa  61.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  23.16 
 
 		 412 aa  61.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.69 
 
 		 787 aa  61.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  21.86 
 
 		 454 aa  60.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  23.08 
 
 		 493 aa  58.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  25.89 
 
 		 672 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  27.71 
 
 		 1131 aa  57  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  21.14 
 
 		 985 aa  57  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1127  hypothetical protein  27.39 
 
 		 404 aa  57.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3640  hypothetical protein  26.29 
 
 		 310 aa  57.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.04717  decreased coverage  0.00729391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  27.7 
 
 		 1479 aa  57.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.87 
 
 		 1186 aa  56.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3313  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 272 aa  56.2  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000795793  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  22.89 
 
 		 909 aa  54.3  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  21.81 
 
 		 850 aa  54.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 937 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1385  TPR repeat-containing protein  20.06 
 
 		 1437 aa  53.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.793645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  20.06 
 
 		 775 aa  53.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  21.66 
 
 		 1054 aa  53.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2442  hypothetical protein  23.48 
 
 		 762 aa  53.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.01518  normal  0.0170954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  26.73 
 
 		 481 aa  53.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 615 aa  52.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 1025 aa  52.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1039 aa  52  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  21.62 
 
 		 620 aa  52  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.14 
 
 		 636 aa  52  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  25.5 
 
 		 1044 aa  51.6  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42809  predicted protein  27.05 
 
 		 323 aa  50.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767843  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1241  TPR repeat-containing protein  22.53 
 
 		 1366 aa  50.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0870262  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  24.62 
 
 		 1914 aa  50.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 		 751 aa  49.3  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  23.55 
 
 		 680 aa  49.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 809 aa  48.9  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.47 
 
 		 1424 aa  48.5  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  22.08 
 
 		 1266 aa  48.5  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  22.04 
 
 		 1238 aa  47.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  26.07 
 
 		 844 aa  48.1  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  33.66 
 
 		 340 aa  48.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  20.27 
 
 		 620 aa  48.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  22.19 
 
 		 799 aa  47.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  21.09 
 
 		 755 aa  47.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  20.58 
 
 		 2327 aa  48.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  23.51 
 
 		 740 aa  48.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  22.34 
 
 		 1228 aa  48.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  22.43 
 
 		 1313 aa  47.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  22.62 
 
 		 809 aa  47.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 		 833 aa  47.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0463  hypothetical protein  30.2 
 
 		 394 aa  47  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.679591  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  30.11 
 
 		 708 aa  47.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 752 aa  47.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  29.37 
 
 		 1553 aa  47  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 686 aa  46.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 857 aa  46.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0167  helix-turn-helix/TPR domain-containing protein  29.41 
 
 		 421 aa  46.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0295  helix-turn-helix/TPR domain protein  29.41 
 
 		 421 aa  46.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5019  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 455 aa  45.8  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.4815  normal  0.111309 
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  29.89 
 
 		 961 aa  45.4  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  21.58 
 
 		 637 aa  45.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 		 444 aa  45.4  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1806  transcriptional regulator, SARP family  23.97 
 
 		 1060 aa  45.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287202  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4376  hypothetical protein  31.58 
 
 		 447 aa  45.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000112995 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 		 1162 aa  45.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1422  serine/threonine protein kinase  25.97 
 
 		 1046 aa  45.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>