39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0463 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0463  hypothetical protein  100 
 
 
394 aa  814    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.679591  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2978  peptidase domain protein  40.89 
 
 
344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4313  peptidase domain-containing protein  38.5 
 
 
340 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0821  peptidase, metallopeptidase  37.5 
 
 
277 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.569838  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1097  hypothetical protein  35.68 
 
 
244 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3181  NTPase (NACHT family)-like protein  40.88 
 
 
1150 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00494273  normal  0.197936 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2601  putative signal transduction protein with NACHT domain  57.78 
 
 
100 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1096  hypothetical protein  32.35 
 
 
223 aa  103  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1530  hypothetical protein  31.22 
 
 
282 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1339  hypothetical protein  31.34 
 
 
277 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.436926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0585  hypothetical protein  36.94 
 
 
419 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2237  Methyltransferase type 12  32.34 
 
 
457 aa  80.9  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0110265  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4249  peptidase M12A, astacin  27.2 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150684  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0499  peptidase M12A, astacin  30.68 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0114  hypothetical protein  24.52 
 
 
384 aa  67  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0873  hypothetical protein  34.39 
 
 
362 aa  65.1  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000000116337  hitchhiker  0.00593532 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2427  putative signal transduction protein with Nacht domain  37.25 
 
 
1044 aa  64.3  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.509479  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4376  hypothetical protein  29.61 
 
 
447 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000112995 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00325  hypothetical protein  28.11 
 
 
353 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.280662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  32.39 
 
 
1427 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4772  hypothetical protein  25.71 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0859  hypothetical protein  31.31 
 
 
593 aa  54.3  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.837601  normal  0.245097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3050  NTPase (NACHT family)-like protein  31.76 
 
 
2216 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.512729 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0219  hypothetical protein  33.65 
 
 
389 aa  51.6  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2006  hypothetical protein  30.3 
 
 
387 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5422  hypothetical protein  24.7 
 
 
397 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000729862  normal  0.0261161 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1812  hypothetical protein  28.76 
 
 
334 aa  50.1  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0881235  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4610  GUN4 domain protein  24.73 
 
 
684 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2602  hypothetical protein  46.51 
 
 
66 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2028  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 
1285 aa  47  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.628704  normal  0.0470638 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0519  hypothetical protein  31.53 
 
 
394 aa  47  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1511  hypothetical protein  38.24 
 
 
347 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6797  hypothetical protein  29.2 
 
 
334 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126734  normal  0.776248 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2826  hypothetical protein  29.9 
 
 
342 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.551029  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0827  ATP-dependent DNA helicase, putative  32.46 
 
 
526 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0965  putative transcriptional regulator  32.46 
 
 
522 aa  43.9  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.111949  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  27.08 
 
 
820 aa  43.9  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1884  hypothetical protein  29.17 
 
 
217 aa  43.5  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0634  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 
502 aa  43.1  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>