144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1446 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  100 
 
 
446 aa  926    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  63.07 
 
 
449 aa  592  1e-168  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  63.16 
 
 
437 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  62.44 
 
 
447 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  57.07 
 
 
436 aa  527  1e-148  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  38.69 
 
 
435 aa  298  1e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  35.57 
 
 
450 aa  259  7e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  33.33 
 
 
428 aa  221  3e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  27.06 
 
 
1293 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  26.93 
 
 
431 aa  183  6e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  30.57 
 
 
500 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  27.91 
 
 
511 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  29.26 
 
 
507 aa  165  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  24.94 
 
 
428 aa  160  3e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  28.54 
 
 
500 aa  161  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  29.07 
 
 
500 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  27.49 
 
 
511 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  26.91 
 
 
496 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  27.44 
 
 
472 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  27 
 
 
421 aa  145  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  28.15 
 
 
454 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  27.82 
 
 
452 aa  143  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  26.13 
 
 
512 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  26.06 
 
 
498 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  25.28 
 
 
524 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  26.15 
 
 
452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  27.62 
 
 
424 aa  140  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  27.4 
 
 
449 aa  139  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  28.49 
 
 
538 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  25.76 
 
 
516 aa  134  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  25.76 
 
 
460 aa  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 
722 aa  133  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  25.91 
 
 
480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  25.16 
 
 
494 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  25.6 
 
 
532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  26.24 
 
 
520 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  24.31 
 
 
427 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  24.31 
 
 
427 aa  125  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  26.13 
 
 
463 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  26.23 
 
 
463 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  26.23 
 
 
463 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  23.77 
 
 
459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  23.77 
 
 
459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  25.76 
 
 
436 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  23.99 
 
 
467 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  24.33 
 
 
465 aa  103  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 
450 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  23.23 
 
 
539 aa  95.1  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  22.57 
 
 
537 aa  94.4  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  22.6 
 
 
549 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  22.09 
 
 
519 aa  86.7  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  22.53 
 
 
538 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  23.21 
 
 
1033 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  20.17 
 
 
465 aa  68.2  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0329  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  23.6 
 
 
431 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  21.46 
 
 
489 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  22.5 
 
 
491 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  22.32 
 
 
432 aa  60.1  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  22.77 
 
 
435 aa  57.4  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  23.25 
 
 
467 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  27.54 
 
 
370 aa  53.5  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  23.48 
 
 
437 aa  53.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1495  hypothetical protein  42.03 
 
 
485 aa  53.1  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.991128  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  24.92 
 
 
460 aa  52.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  23.15 
 
 
412 aa  51.6  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  50 
 
 
468 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  22.84 
 
 
427 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  22.09 
 
 
423 aa  50.4  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  21.84 
 
 
419 aa  50.1  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  21.54 
 
 
444 aa  49.7  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0404  FAD dependent oxidoreductase  21.91 
 
 
443 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  50 
 
 
468 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  21.19 
 
 
470 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  50 
 
 
468 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  39.13 
 
 
424 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  40.58 
 
 
424 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  20.75 
 
 
471 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  22.12 
 
 
366 aa  47.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  21.89 
 
 
445 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  20.5 
 
 
429 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  44 
 
 
522 aa  47.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  44 
 
 
503 aa  47.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  25.15 
 
 
502 aa  47  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  25.15 
 
 
502 aa  47  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  23.53 
 
 
436 aa  47  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  43.14 
 
 
488 aa  47  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  37.5 
 
 
424 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 
425 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  22.41 
 
 
465 aa  46.2  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7145  squalene-associated FAD-dependent desaturase  38.81 
 
 
438 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  22.73 
 
 
461 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  43.14 
 
 
488 aa  46.2  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  31.87 
 
 
450 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  31.87 
 
 
450 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  38.89 
 
 
361 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  23.13 
 
 
434 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  43.75 
 
 
437 aa  46.2  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  22.73 
 
 
436 aa  45.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  43.4 
 
 
566 aa  45.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  30.77 
 
 
599 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>