More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2306 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 		 863 aa  1729    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  40.05 
 
 		 867 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  39.88 
 
 		 937 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  40.12 
 
 		 937 aa  548  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.62 
 
 		 1107 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  42.9 
 
 		 892 aa  513  1e-144  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  40.74 
 
 		 1041 aa  494  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  41.17 
 
 		 886 aa  477  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  39.07 
 
 		 1015 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 925 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0508  Rab family protein  36.45 
 
 		 811 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.356844  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  30.07 
 
 		 761 aa  354  2.9999999999999997e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1428  Miro-like  34.46 
 
 		 748 aa  234  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  23.65 
 
 		 1085 aa  188  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  43.46 
 
 		 482 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  41.13 
 
 		 416 aa  172  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  38.67 
 
 		 1263 aa  168  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  38.08 
 
 		 508 aa  164  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  33.69 
 
 		 354 aa  162  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0507  hypothetical protein  25.99 
 
 		 614 aa  156  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37047  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  38.28 
 
 		 1749 aa  147  7.0000000000000006e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.23 
 
 		 472 aa  128  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  33.7 
 
 		 713 aa  127  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  36.4 
 
 		 307 aa  125  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  40.72 
 
 		 448 aa  125  5e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  35.5 
 
 		 242 aa  122  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  29.6 
 
 		 1344 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  39.6 
 
 		 776 aa  120  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  36.55 
 
 		 2491 aa  118  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.64 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  29.72 
 
 		 1266 aa  114  6e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  36.21 
 
 		 757 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  40.43 
 
 		 296 aa  112  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1476  Miro domain protein  32.13 
 
 		 998 aa  112  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184541  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  37.78 
 
 		 204 aa  110  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2479  hypothetical protein  37.13 
 
 		 788 aa  106  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.869607  normal  0.03769 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  41.74 
 
 		 631 aa  105  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  33.33 
 
 		 1024 aa  105  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2425  leucine-rich repeat protein  37.66 
 
 		 788 aa  105  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.190923 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2582  hypothetical protein  37.66 
 
 		 788 aa  105  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  41.78 
 
 		 291 aa  104  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  32.86 
 
 		 1351 aa  101  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  29.22 
 
 		 467 aa  101  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  34.36 
 
 		 460 aa  98.6  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  34.81 
 
 		 437 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  33.48 
 
 		 230 aa  97.8  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  35.37 
 
 		 565 aa  97.1  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  32.31 
 
 		 396 aa  94.7  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  33.7 
 
 		 413 aa  94  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  31.84 
 
 		 453 aa  94  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0863  leucine-rich repeat protein  32.06 
 
 		 755 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0926  hypothetical protein  33.99 
 
 		 731 aa  93.2  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.494882  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  32.34 
 
 		 447 aa  92.8  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  33.13 
 
 		 293 aa  93.6  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  32.06 
 
 		 755 aa  93.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0894  hypothetical protein  32.06 
 
 		 755 aa  93.2  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  27.14 
 
 		 559 aa  92.8  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1744 aa  92  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  30 
 
 		 451 aa  92  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 		 447 aa  92  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 471 aa  91.7  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  32.18 
 
 		 447 aa  91.7  6e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 		 437 aa  91.3  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 		 437 aa  91.3  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  29.29 
 
 		 1088 aa  90.9  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  33.51 
 
 		 439 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  37.08 
 
 		 475 aa  90.9  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  33.78 
 
 		 972 aa  90.1  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0835  leucine-rich repeat protein  31.16 
 
 		 765 aa  90.1  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.226799  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  27.51 
 
 		 437 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12550  predicted protein  33.47 
 
 		 283 aa  89  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  30.34 
 
 		 2132 aa  88.6  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  30.22 
 
 		 558 aa  89  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  29.85 
 
 		 451 aa  88.2  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  29.85 
 
 		 451 aa  88.2  6e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  31.09 
 
 		 444 aa  88.2  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  30.84 
 
 		 478 aa  87.8  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 451 aa  88.2  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  36.56 
 
 		 304 aa  87.4  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  32.92 
 
 		 440 aa  87  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  33.51 
 
 		 421 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1090  serine/threonine protein kinase  32.34 
 
 		 441 aa  87  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16261  predicted protein  30.45 
 
 		 249 aa  85.9  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  38.89 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2354  leucine-rich repeat protein  38.22 
 
 		 286 aa  85.5  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.6201199999999996e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  28.09 
 
 		 441 aa  85.5  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  29.38 
 
 		 473 aa  85.5  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  31.84 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  28.68 
 
 		 640 aa  85.1  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  29.75 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  31.95 
 
 		 802 aa  85.1  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  29.78 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  29.06 
 
 		 648 aa  84  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32300  putative kinase  26.38 
 
 		 499 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  28.09 
 
 		 528 aa  82.8  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0746  leucine-rich repeat-containing protein  35.71 
 
 		 615 aa  82.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0814  serine/threonine protein kinase  28.19 
 
 		 432 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.825478  normal  0.301688 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  25.69 
 
 		 716 aa  82.8  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  31.13 
 
 		 772 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>