More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1794 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  447  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  37.07 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3782  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.608196 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 202 aa  62  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 260 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 376 aa  59.3  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 291 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  35.58 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  42.59 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  42.47 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3562  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137861 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  31.4 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  33.72 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  38.18 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 287 aa  55.1  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  28.15 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  22.98 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  43.4 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  45.31 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>