More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0433 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
204 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  84.31 
 
 
204 aa  358  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0615  TetR family transcriptional regulator  90 
 
 
140 aa  256  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
227 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  34.5 
 
 
225 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
215 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
226 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  35.06 
 
 
207 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 
198 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
201 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 
188 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
239 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
207 aa  106  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
200 aa  101  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  38.37 
 
 
211 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
211 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
197 aa  99.4  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  32.2 
 
 
202 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
210 aa  95.5  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 
204 aa  89  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
200 aa  89  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 
287 aa  89  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 
204 aa  88.2  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  29.29 
 
 
197 aa  88.2  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 
205 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 
205 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 
215 aa  84.7  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
223 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 
223 aa  82  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 
183 aa  81.3  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
206 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  28.96 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 
256 aa  79  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 
222 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
224 aa  78.6  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 
246 aa  75.5  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  20.77 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 
209 aa  74.7  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 
217 aa  73.9  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  27.32 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
770 aa  72.4  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  23.5 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  20.99 
 
 
208 aa  72  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 
189 aa  72  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 
197 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
209 aa  71.6  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 
260 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  22.98 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  27.56 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  27.42 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 
211 aa  68.2  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>