152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0183 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0183  TonB family protein  100 
 
 
251 aa  487  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.144886  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  45 
 
 
250 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  34.42 
 
 
268 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  29 
 
 
336 aa  86.3  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  32 
 
 
268 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  32.06 
 
 
268 aa  82  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1243  TonB-like protein  30.53 
 
 
292 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122386  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  32.64 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  35.5 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2420  TonB family protein  39.13 
 
 
285 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  38.04 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  27.72 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  35.48 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  32.03 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  29.35 
 
 
288 aa  68.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  30.61 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  37.36 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  40.4 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  40.4 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  40.4 
 
 
267 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  33.33 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  26.9 
 
 
279 aa  65.5  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1027  TonB, C-terminal  36.73 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  33.13 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  33.13 
 
 
242 aa  64.7  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  37.63 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  27.49 
 
 
324 aa  62.4  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3641  TonB-like  34.74 
 
 
251 aa  62  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  29.75 
 
 
289 aa  62  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  56.72 
 
 
444 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  26.59 
 
 
212 aa  61.2  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  32.26 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2906  TonB-like  31.17 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155829  normal  0.22869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  29.1 
 
 
292 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  34.17 
 
 
295 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  37.62 
 
 
237 aa  60.1  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  31.22 
 
 
273 aa  59.3  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0369  TonB-like protein  27.89 
 
 
300 aa  59.3  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  54.05 
 
 
489 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2092  TonB-like protein  27.17 
 
 
264 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.014367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3965  TonB family protein  27.86 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0789  TonB-like protein  32.53 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000813282  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5356  TonB family protein  37.18 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5308  TonB family protein  37.18 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  33.68 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0575  TonB family protein  30.19 
 
 
270 aa  56.6  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0749  TonB-like  29.58 
 
 
269 aa  57  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5217  TonB family protein  37.18 
 
 
243 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.315671 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  55.22 
 
 
484 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3331  TonB-like  27.31 
 
 
264 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.616701 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0174  TonB-dependent colicin receptor protein, putative  30.93 
 
 
248 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  27.14 
 
 
305 aa  55.8  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1499  TonB family protein  27.27 
 
 
281 aa  55.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0203  TonB, C-terminal  32.63 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0613  TonB family protein  37.74 
 
 
495 aa  55.5  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00466387 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4542  TonB-like  32.61 
 
 
265 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0705  TonB protein  33.33 
 
 
267 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2038  TonB like protein  33.33 
 
 
267 aa  54.7  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.970768  normal  0.85242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  54.41 
 
 
926 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  33.33 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2359  TonB-like  31.52 
 
 
278 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  28.14 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1307  putative energy transducer TonB  28.72 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.217867  normal  0.59147 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2717  TonB family protein  33.33 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  33.68 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3063  TonB family protein  28.5 
 
 
264 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0476406  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  28.77 
 
 
274 aa  53.1  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5557  TonB-like  33.68 
 
 
248 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3402  hypothetical protein  26.17 
 
 
431 aa  52  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.904792 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  30.57 
 
 
292 aa  52  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  50 
 
 
239 aa  52  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1417  serine protease  28.36 
 
 
1175 aa  51.6  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  23.35 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  34.23 
 
 
266 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  24.44 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  46.59 
 
 
423 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0327  tonB1 protein  30.46 
 
 
249 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000128507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3545  putative energy transducer TonB  29.13 
 
 
269 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  35.8 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0708  TonB family protein  25 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  36.36 
 
 
1281 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  59.32 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10610  TonB protein  37.14 
 
 
280 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.94051  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1158  TonB-like  33.33 
 
 
297 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000294867  decreased coverage  0.0031097 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2512  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  29.67 
 
 
411 aa  50.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.929963  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  34.13 
 
 
525 aa  50.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  31.76 
 
 
261 aa  50.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  30.07 
 
 
1888 aa  49.3  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  27.27 
 
 
171 aa  49.3  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  52.54 
 
 
1261 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  33.96 
 
 
2272 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0443  TonB family protein  31.76 
 
 
284 aa  48.9  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  53.33 
 
 
501 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1982  TonB-like  31.46 
 
 
266 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.153841  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3339  TonB family protein  28.09 
 
 
284 aa  48.9  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000004715  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0902  TonB family protein  41.43 
 
 
164 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.377774  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  31.14 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3908  TonB, C-terminal  29.86 
 
 
296 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  36.17 
 
 
296 aa  48.1  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0898  TonB family protein  41.43 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>