131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0726 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0726  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.892311  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0992  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3058  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000151008  decreased coverage  0.0000000705144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 173 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 173 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2323  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.169023  normal  0.0173664 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5224  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1245  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 234 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  31.85 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3846  regulatory protein TetR  37.88 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6398  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237377  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2544  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0158307  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 187 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1333  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3262  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00457442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 206 aa  44.7  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2888  regulatory protein TetR  24.38 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0324  TetR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0334  TetR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0313  TetR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1605  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 242 aa  42.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2760  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000891417  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2838  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  35.85 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 214 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  41.18 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3667  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50901  normal  0.427463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 185 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 224 aa  42.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19560  transcriptional regulator, tetR family  24.6 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186862  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 182 aa  42  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2654  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  39.62 
 
 		 207 aa  42  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2697  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3723  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 187 aa  42  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000134359  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 193 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  32.39 
 
 		 202 aa  42  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 248 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  36.54 
 
 		 198 aa  42  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 235 aa  42  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 237 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 178 aa  42  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 211 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 213 aa  41.6  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 199 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>