More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3253 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3253  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  390  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4440  transcriptional regulator, TetR family  80.75 
 
 		 187 aa  270  8.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567704  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  24.51 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  24.51 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  23.04 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  38.38 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6809  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.318139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 247 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  35.29 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 226 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 446 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 246 aa  52.4  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  22.15 
 
 		 251 aa  52  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3001  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 223 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2337  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000766652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  28.82 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  46.43 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 437 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 238 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00480  transcriptional regulator TetR/acrR family  31.33 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  21.91 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 173 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  27.98 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>