More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3165 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3165  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.317931  normal  0.242045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0222  ABC transporter related  92.98 
 
 		 243 aa  430  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  67.97 
 
 		 232 aa  324  6e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1576  ABC transporter related  67.97 
 
 		 231 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4171  ABC transporter related  68.4 
 
 		 231 aa  322  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4568  ABC transporter related  66.67 
 
 		 232 aa  318  5e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.272221  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1754  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  64.05 
 
 		 239 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  61.28 
 
 		 235 aa  301  5.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1491  ABC transporter related  63.52 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318894  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2926  ABC transporter related  61.9 
 
 		 231 aa  299  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103898  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1450  ABC transporter related  63.09 
 
 		 239 aa  298  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0957848  hitchhiker  0.000807382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1774  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  61.28 
 
 		 236 aa  296  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.328885  normal  0.085306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1841  ABC transporter related  63.2 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.373128 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  60.52 
 
 		 237 aa  295  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3312  ABC transporter related  61.04 
 
 		 231 aa  294  8e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000555614  hitchhiker  0.00984182 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  60.61 
 
 		 231 aa  293  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  61.37 
 
 		 237 aa  291  9e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2021  ABC transporter related  59.31 
 
 		 231 aa  288  5.0000000000000004e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0684522  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1683  ABC transporter related  59.31 
 
 		 231 aa  287  8e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  58.87 
 
 		 231 aa  284  7e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1853  ABC transporter-related protein  61.28 
 
 		 235 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2930  ABC transporter-related protein  61.47 
 
 		 231 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.208893  normal  0.372931 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1577  ABC transporter related  60.26 
 
 		 238 aa  280  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.787524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0028  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 238 aa  274  9e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0025  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  58.37 
 
 		 238 aa  270  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  52.38 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  52.38 
 
 		 237 aa  237  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  52.81 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  51.95 
 
 		 235 aa  231  6e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  50.22 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  49.78 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  50.65 
 
 		 234 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  51.08 
 
 		 233 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2814  ABC transporter related  49.15 
 
 		 237 aa  224  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0747835 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 236 aa  224  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  50.65 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  50.65 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  47.83 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 234 aa  223  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1604  ABC transporter related  48.09 
 
 		 237 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  47.01 
 
 		 234 aa  220  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0660  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  47.44 
 
 		 237 aa  218  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4329  ABC transporter related  47.44 
 
 		 237 aa  218  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  49.58 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1321  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  48.29 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  49.58 
 
 		 259 aa  217  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  48.72 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  48.29 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  48.72 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  48.32 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  46.64 
 
 		 244 aa  211  5.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4218  ABC transporter related  46.12 
 
 		 234 aa  211  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.110724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  50.85 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1376  ABC transporter related  45.42 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.374961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  48.29 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  44.98 
 
 		 231 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  44.98 
 
 		 231 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2431  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding proteinputative  47.41 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4076  ABC transporter related  46.75 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.98 
 
 		 231 aa  207  9e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2866  ABC transporter related  52.83 
 
 		 233 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.699047 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3528  ABC transporter related  46.75 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.140844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  47.83 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  46.4 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  45.49 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  46.85 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  43.48 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  45.49 
 
 		 237 aa  206  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1673  ABC transporter related  46.75 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  46.22 
 
 		 237 aa  204  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1755  ABC transporter related  46.55 
 
 		 234 aa  204  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  49.78 
 
 		 230 aa  204  9e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  45.69 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1715  ABC transporter related  48.58 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0199922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  49.76 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  49.76 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2029  ABC transporter related  49.57 
 
 		 246 aa  202  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.178802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  47.41 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3592  ABC transporter-related protein  48.57 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  49.29 
 
 		 232 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7910  ABC transporter related  48.26 
 
 		 275 aa  201  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1660  ABC transporter related  45.26 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3166  ABC transporter related  46.58 
 
 		 248 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.633767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  45.3 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  46.08 
 
 		 248 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  43.5 
 
 		 256 aa  199  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  43.78 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1400  ABC transporter related  48.2 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.656641  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2496  ABC transporter related protein  45.69 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.558412  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1261  ABC transporter related  43.53 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  46.19 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  43.35 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0419  ABC transporter-like protein  45.22 
 
 		 240 aa  199  5e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3305  ABC transporter component  47.86 
 
 		 242 aa  198  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  45.53 
 
 		 237 aa  198  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  45.73 
 
 		 239 aa  198  7e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6267  ABC transporter related  46.32 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  45.69 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>