More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1726 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  57.5 
 
 		 801 aa  835    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  45.79 
 
 		 762 aa  635    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  56.59 
 
 		 726 aa  754    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1303  exoribonuclease R  47.46 
 
 		 779 aa  637    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00042422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  100 
 
 		 774 aa  1596    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  46.69 
 
 		 758 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  44.17 
 
 		 810 aa  614  9.999999999999999e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  44.68 
 
 		 808 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  44.68 
 
 		 804 aa  609  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  44.55 
 
 		 806 aa  609  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  44.68 
 
 		 808 aa  610  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  44.67 
 
 		 810 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  44.55 
 
 		 806 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  44.15 
 
 		 812 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  44.67 
 
 		 808 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  44.01 
 
 		 790 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  43.9 
 
 		 814 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  44.9 
 
 		 792 aa  602  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  44.15 
 
 		 806 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  44.01 
 
 		 790 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  44.55 
 
 		 792 aa  601  1e-170  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  42.5 
 
 		 801 aa  570  1e-161  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  39.59 
 
 		 817 aa  564  1.0000000000000001e-159  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  44.71 
 
 		 903 aa  531  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  43.36 
 
 		 751 aa  525  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  43.14 
 
 		 751 aa  522  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  42.4 
 
 		 706 aa  517  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  41.56 
 
 		 716 aa  513  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  41.09 
 
 		 788 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  40.19 
 
 		 715 aa  496  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  39.66 
 
 		 709 aa  493  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  41.18 
 
 		 706 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  42.77 
 
 		 757 aa  486  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  41.01 
 
 		 716 aa  483  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  40.33 
 
 		 759 aa  485  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  38.9 
 
 		 763 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  41.24 
 
 		 667 aa  483  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  39.59 
 
 		 770 aa  477  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  43.34 
 
 		 722 aa  475  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  40.9 
 
 		 710 aa  475  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  40.9 
 
 		 710 aa  474  1e-132  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  41.19 
 
 		 752 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  41.09 
 
 		 705 aa  466  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  37.53 
 
 		 777 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  40.58 
 
 		 763 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  38.9 
 
 		 737 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  38.62 
 
 		 737 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  40.3 
 
 		 1055 aa  451  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  42.88 
 
 		 704 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  42.4 
 
 		 766 aa  443  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  36.69 
 
 		 720 aa  444  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  38.51 
 
 		 840 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  38.88 
 
 		 737 aa  433  1e-120  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  37.32 
 
 		 818 aa  436  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  37.08 
 
 		 801 aa  433  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  38.55 
 
 		 758 aa  434  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  36.08 
 
 		 937 aa  431  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3289  ribonuclease R  37.85 
 
 		 824 aa  428  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457006  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2432  ribonuclease R  38.3 
 
 		 858 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1938  ribonuclease R  37.36 
 
 		 829 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.751615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3355  ribonuclease R  37.71 
 
 		 829 aa  423  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  38.77 
 
 		 708 aa  423  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  37.08 
 
 		 805 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  38.32 
 
 		 758 aa  421  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  36.25 
 
 		 817 aa  420  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3965  ribonuclease R  35.3 
 
 		 827 aa  420  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120955  normal  0.449748 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1431  ribonuclease R  37.75 
 
 		 857 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.746592  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3264  RNAse R  35.92 
 
 		 808 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000483036  decreased coverage  0.00000524837 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1228  exoribonuclease RNase R  36.72 
 
 		 871 aa  419  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00057752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1164  ribonuclease R  37.77 
 
 		 848 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  38.37 
 
 		 746 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  38.37 
 
 		 746 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0683  RNAse R  35.66 
 
 		 808 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0668572  hitchhiker  0.000463961 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0697  RNAse R  35.92 
 
 		 809 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112836  hitchhiker  0.000328486 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  38.6 
 
 		 755 aa  414  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0986  exoribonuclease II  37.77 
 
 		 836 aa  415  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  37.18 
 
 		 722 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4636  exoribonuclease R  34.33 
 
 		 812 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0728  ribonuclease R  36.28 
 
 		 807 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.14505  hitchhiker  0.000000257568 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  37.13 
 
 		 735 aa  413  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  36.32 
 
 		 828 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0707  ribonuclease R  36.28 
 
 		 807 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.419789  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  36.55 
 
 		 826 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3647  ribonuclease R  36.15 
 
 		 807 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0028274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0737  ribonuclease R  36.28 
 
 		 807 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.034125  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0749  ribonuclease R  35.46 
 
 		 807 aa  413  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000988982  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  35.36 
 
 		 833 aa  416  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1072  ribonuclease R  36.85 
 
 		 864 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1526  ribonuclease R  37.99 
 
 		 857 aa  412  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3417  ribonuclease R  35.64 
 
 		 834 aa  413  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.629084 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  35.39 
 
 		 813 aa  411  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  35.39 
 
 		 813 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3935  ribonuclease R  36.24 
 
 		 808 aa  412  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4710  exoribonuclease R  35.39 
 
 		 813 aa  411  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0106  hypothetical protein  36.39 
 
 		 726 aa  412  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0091  hypothetical protein  35.95 
 
 		 726 aa  409  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  35.39 
 
 		 813 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  35.39 
 
 		 813 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0868  ribonuclease R  37.34 
 
 		 838 aa  410  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  37.79 
 
 		 810 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>