More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18390 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_18390  transcription termination factor Rho  100 
 
 		 721 aa  1429    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.945824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1651  transcription termination factor Rho  52.77 
 
 		 704 aa  615  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271851  normal  0.770035 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3935  transcription termination factor Rho  72.96 
 
 		 679 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0886  transcription termination factor Rho  75.13 
 
 		 605 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.562598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2353  transcription termination factor Rho  75.19 
 
 		 711 aa  607  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000144518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2620  transcription termination factor Rho  60.4 
 
 		 729 aa  607  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2421  transcription termination factor Rho  66.07 
 
 		 644 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09900  transcription termination factor Rho  49.93 
 
 		 751 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0633  transcription termination factor Rho  72.45 
 
 		 676 aa  598  1e-170  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0304997  decreased coverage  0.0015914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0321  transcription termination factor Rho  73.13 
 
 		 662 aa  595  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.440265 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08060  transcription termination factor Rho  72.56 
 
 		 712 aa  586  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19310  transcription termination factor Rho  72.96 
 
 		 713 aa  586  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.650817  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1202  transcription termination factor Rho  72.12 
 
 		 668 aa  572  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.246855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1284  transcription termination factor Rho  70.54 
 
 		 645 aa  572  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.287408 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29930  transcription termination factor Rho  61.54 
 
 		 613 aa  566  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.660333 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1787  transcription termination factor Rho  68.77 
 
 		 680 aa  568  1e-160  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.810933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4028  transcription termination factor Rho  56.23 
 
 		 688 aa  566  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2098  transcription termination factor Rho  70.03 
 
 		 717 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0421474  normal  0.100446 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3722  transcription termination factor Rho  69.51 
 
 		 698 aa  561  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.672937  normal  0.45086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6153  transcription termination factor Rho  68.8 
 
 		 709 aa  557  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.874638  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1008  transcription termination factor Rho  68.73 
 
 		 670 aa  556  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.588232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0110  transcription termination factor Rho  47.22 
 
 		 656 aa  554  1e-156  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1747  transcription termination factor Rho  69.51 
 
 		 578 aa  553  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.179757  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11324  transcription termination factor Rho  61.28 
 
 		 602 aa  551  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.329237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1904  transcription termination factor Rho  68.02 
 
 		 662 aa  549  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1301  transcription termination factor Rho  60.26 
 
 		 597 aa  545  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2462  transcription termination factor Rho  65.26 
 
 		 674 aa  545  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.683247  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3646  transcription termination factor Rho  68.48 
 
 		 675 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1200  transcription termination factor Rho  66.41 
 
 		 689 aa  541  9.999999999999999e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1233  transcription termination factor Rho  66.33 
 
 		 653 aa  541  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303183  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2301  transcription termination factor Rho  68.04 
 
 		 691 aa  535  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4345  transcription termination factor Rho  67.79 
 
 		 684 aa  538  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4746  transcription termination factor Rho  62.88 
 
 		 393 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09300  transcription termination factor Rho  59.43 
 
 		 638 aa  476  1e-133  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.270012 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1811  transcription termination factor Rho  57.44 
 
 		 594 aa  479  1e-133  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.186015  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1088  transcription termination factor Rho  60.68 
 
 		 546 aa  477  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00846053  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23670  transcription termination factor Rho  59.64 
 
 		 685 aa  471  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0108296  normal  0.784338 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1655  transcription termination factor Rho  57.43 
 
 		 498 aa  461  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.647483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2560  transcription termination factor Rho  58.35 
 
 		 406 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.910753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1339  transcription termination factor Rho  56.96 
 
 		 642 aa  457  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0407  transcription termination factor Rho  58.16 
 
 		 383 aa  452  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3627  transcription termination factor Rho  56.81 
 
 		 420 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.2483  normal  0.795626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2174  transcription termination factor Rho  54.97 
 
 		 653 aa  450  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000672374  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0843  transcription termination factor Rho  57.94 
 
 		 415 aa  450  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000858809  normal  0.0802102 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69190  transcription termination factor Rho  57.48 
 
 		 419 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5982  transcription termination factor Rho  57.48 
 
 		 419 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3222  transcription termination factor Rho  57.22 
 
 		 444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.584785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5242  transcription termination factor Rho  56.48 
 
 		 419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0301  transcription termination factor Rho  56.48 
 
 		 419 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3710  transcription termination factor Rho  57.48 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238599  hitchhiker  0.000000242256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5214  transcription termination factor Rho  56.22 
 
 		 419 aa  446  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00426874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5037  transcription termination factor Rho  56.22 
 
 		 419 aa  446  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3377  transcription termination factor Rho  56.92 
 
 		 416 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000542218  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0405  transcription termination factor Rho  56.04 
 
 		 421 aa  443  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0677  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 		 415 aa  444  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000284119  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5275  transcription termination factor Rho  56.22 
 
 		 419 aa  446  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5123  transcription termination factor Rho  56.22 
 
 		 419 aa  446  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5456  transcription termination factor Rho  56.22 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234949 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3229  transcription termination factor Rho  57.67 
 
 		 415 aa  444  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000548676  normal  0.0477745 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0367  transcription termination factor Rho  53.14 
 
 		 418 aa  444  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1824  transcription termination factor Rho  56.81 
 
 		 422 aa  445  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2651  transcription termination factor Rho  57.41 
 
 		 415 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000111099  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3376  transcription termination factor Rho  54.83 
 
 		 690 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000138614  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3930  transcription termination factor Rho  55.53 
 
 		 421 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3953  transcription termination factor Rho  55.78 
 
 		 421 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1456  transcription termination factor Rho  56.2 
 
 		 431 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00134709  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3434  transcription termination factor Rho  55.78 
 
 		 421 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3656  transcription termination factor Rho  53.69 
 
 		 419 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.04416  normal  0.624434 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0531  transcription termination factor Rho  56.84 
 
 		 701 aa  442  9.999999999999999e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000460455 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3808  transcription termination factor Rho  57.41 
 
 		 415 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3713  transcription termination factor Rho  57.41 
 
 		 415 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000184202  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3603  transcription termination factor Rho  51.92 
 
 		 573 aa  442  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.177753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3878  transcription termination factor Rho  55.53 
 
 		 421 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0409  transcription termination factor Rho  55.78 
 
 		 421 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3616  transcription termination factor Rho  55.78 
 
 		 421 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4071  transcription termination factor Rho  55.53 
 
 		 421 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.339421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0408  transcription termination factor Rho  55.78 
 
 		 421 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.011685 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01045  transcription termination factor Rho  42.09 
 
 		 579 aa  439  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5202  transcription termination factor Rho  50.34 
 
 		 602 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0491  transcription termination factor Rho  56.2 
 
 		 416 aa  438  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000212536 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2695  transcription termination factor Rho  57.18 
 
 		 415 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000315458  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0447  transcription termination factor Rho  55.01 
 
 		 421 aa  437  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0584  transcription termination factor Rho  53.88 
 
 		 419 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.290432  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1295  transcription termination factor Rho  50.11 
 
 		 750 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.623564 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3070  transcription termination factor Rho  52.36 
 
 		 615 aa  438  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.581675  hitchhiker  0.00476927 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0459  transcription termination factor Rho  56.17 
 
 		 420 aa  437  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3217  transcription termination factor Rho  56.43 
 
 		 420 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1562  transcription termination factor Rho  56.2 
 
 		 449 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.135636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0397  transcription termination factor Rho  55.27 
 
 		 421 aa  438  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0778  transcription termination factor Rho  57.33 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3002  transcription termination factor Rho  55.12 
 
 		 420 aa  432  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2863  transcription termination factor Rho  55.12 
 
 		 420 aa  432  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0512  transcription termination factor Rho  54.5 
 
 		 421 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.855654  hitchhiker  0.00605573 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2130  transcription termination factor Rho  55.53 
 
 		 503 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00148034  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0126  transcription termination factor Rho  56.81 
 
 		 419 aa  435  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000206271  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0337  transcription termination factor Rho  55.01 
 
 		 421 aa  434  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47410  transcription termination factor Rho  57.74 
 
 		 419 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0658  transcription termination factor Rho  52.88 
 
 		 418 aa  432  1e-120  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4065  transcription termination factor Rho  56.88 
 
 		 415 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000187673  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1711  transcription termination factor Rho  57.14 
 
 		 437 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000145962  normal  0.971448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>