170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2813 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2813  regulatory protein TetR  100 
 
 		 182 aa  352  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  38.8 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5157  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 193 aa  84.3  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 228 aa  71.2  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  62.07 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 217 aa  62  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  32.8 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  59.62 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 299 aa  57.8  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  47.14 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4496  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  31.74 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4583  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.204371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4879  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.089814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3163  putative transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 223 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  30.69 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0982  regulatory protein TetR  35.94 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 222 aa  52  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0387  regulatory protein TetR  34.36 
 
 		 211 aa  52  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.618226  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 194 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 173 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2444  regulatory protein TetR  31.76 
 
 		 195 aa  51.2  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0957068  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4122  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 217 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3302  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 245 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1492  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0767  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.504408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 183 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2145  regulatory protein TetR  50.77 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  46.48 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  33.79 
 
 		 223 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 223 aa  48.5  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 213 aa  48.5  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 188 aa  48.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  41.79 
 
 		 231 aa  48.1  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  41.43 
 
 		 191 aa  48.1  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 199 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 216 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 259 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 259 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 288 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 259 aa  47.8  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 257 aa  47.8  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6690  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  58.7 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2186  regulatory protein, TetR  32.77 
 
 		 237 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02120  transcriptional regulator, tetR family  29.52 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19222  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>