More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0518 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 397 aa  768    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  36.49 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1694  permease-like protein  36.18 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111642  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0829  protein of unknown function UPF0118  37.2 
 
 		 422 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0384263  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  32.58 
 
 		 373 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  33.33 
 
 		 529 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  31.21 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3615  hypothetical protein  32.4 
 
 		 412 aa  133  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  32.94 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3997  hypothetical protein  31.23 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00194517  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8629  permease-like protein  34.63 
 
 		 423 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1608  hypothetical protein  35.94 
 
 		 371 aa  119  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.55717  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4330  protein of unknown function UPF0118  31 
 
 		 358 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1700  hypothetical protein  31.81 
 
 		 429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6535  protein of unknown function UPF0118  26.71 
 
 		 394 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.278292  normal  0.0349253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0195  protein of unknown function UPF0118  30.79 
 
 		 486 aa  110  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1247  protein of unknown function UPF0118  28.5 
 
 		 388 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2641  protein of unknown function UPF0118  28.96 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517547  normal  0.208528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  29.26 
 
 		 358 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  29.28 
 
 		 387 aa  106  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0209  protein of unknown function UPF0118  28.78 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5642  protein of unknown function UPF0118  27.83 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.45964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0322  hypothetical protein  30.85 
 
 		 487 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.084246  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  27.58 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0279  hypothetical protein  31.19 
 
 		 423 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0267805 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  29.23 
 
 		 344 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  30.75 
 
 		 345 aa  99.4  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2329  protein of unknown function UPF0118  27.27 
 
 		 436 aa  99  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000385102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  29.2 
 
 		 464 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  28.2 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  25.57 
 
 		 460 aa  97.1  5e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1352  protein of unknown function UPF0118  23.66 
 
 		 438 aa  96.7  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  33.56 
 
 		 381 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1485  protein of unknown function UPF0118  25.66 
 
 		 455 aa  95.1  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.823858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  33.56 
 
 		 381 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  33.56 
 
 		 381 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2153  protein of unknown function UPF0118  24.5 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  30.61 
 
 		 383 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  24.21 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  27.24 
 
 		 345 aa  93.6  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  26.91 
 
 		 383 aa  94  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  27.89 
 
 		 361 aa  93.2  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  25.44 
 
 		 349 aa  92.8  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  25.15 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  25.15 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  25.15 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  26.73 
 
 		 361 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  23.86 
 
 		 392 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  25.15 
 
 		 348 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  26.73 
 
 		 361 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  24.54 
 
 		 361 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0221  protein of unknown function UPF0118  27.6 
 
 		 364 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2596  hypothetical protein  27.41 
 
 		 371 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  29 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  26.73 
 
 		 373 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  26.73 
 
 		 348 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2233  hypothetical protein  24.46 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.195735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  25 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  25.38 
 
 		 393 aa  91.7  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2806  protein of unknown function UPF0118  28.99 
 
 		 387 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00669184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  28.46 
 
 		 389 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  29.72 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2491  protein of unknown function UPF0118  27.52 
 
 		 353 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  26.73 
 
 		 361 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  28.19 
 
 		 339 aa  91.3  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  27.91 
 
 		 370 aa  90.9  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21060  predicted permease  31.5 
 
 		 436 aa  90.5  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.152627  normal  0.29168 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  26.69 
 
 		 365 aa  89  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1050  protein of unknown function UPF0118  33.06 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  26.9 
 
 		 426 aa  89  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0978  hypothetical protein  31.56 
 
 		 452 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.42646  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  22.13 
 
 		 396 aa  88.6  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1161  hypothetical protein  30 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2026  protein of unknown function UPF0118  28.94 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1315  protein of unknown function UPF0118  29.01 
 
 		 369 aa  88.6  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.494628  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1236  protein of unknown function UPF0118  28.57 
 
 		 439 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000518014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2165  hypothetical protein  28.33 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.128502  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  28.95 
 
 		 362 aa  87.4  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1139  hypothetical protein  23.93 
 
 		 526 aa  87  5e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  26.25 
 
 		 373 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4482  protein of unknown function UPF0118  28.02 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.255906  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2437  protein of unknown function UPF0118  26.54 
 
 		 386 aa  87  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000151216  normal  0.0209402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  25.79 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  23.17 
 
 		 405 aa  86.7  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  24.85 
 
 		 371 aa  86.3  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3105  hypothetical protein  26.4 
 
 		 389 aa  86.3  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  23.29 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  23.29 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  23.29 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  23.29 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  23.29 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1453  protein of unknown function UPF0118  28.22 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10207  transmembrane protein  31.29 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3466  protein of unknown function UPF0118  26.71 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.254752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0195  hypothetical protein  29.63 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3786  protein of unknown function UPF0118  25.51 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.262236  normal  0.0203414 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  22.01 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3009  protein of unknown function UPF0118  24.93 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2286  protein of unknown function UPF0118  29.43 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0673264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  24.1 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>