More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0172 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0172  response regulator receiver protein  100 
 
 		 128 aa  243  8e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2452  response regulator receiver protein  47.5 
 
 		 151 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.843497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2443  LuxR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 497 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1559  ATPase-like protein  49.18 
 
 		 916 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  33.1 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 781 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06950  LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 496 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.490761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0636  LuxR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 496 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  32.39 
 
 		 232 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 232 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  46.77 
 
 		 496 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3716  two component LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 209 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.576881  normal  0.099275 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3357  two component LuxR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 238 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.1255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3324  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.96 
 
 		 219 aa  52  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107044  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3763  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 221 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0403461 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2809  regulatory protein, LuxR  50.79 
 
 		 286 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7667  two component LuxR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 209 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0647  two component LuxR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 225 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3278  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 214 aa  52  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4865  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 281 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0959639 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38740  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  38.1 
 
 		 250 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2609  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 562 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000030036  hitchhiker  0.00837555 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 188 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3199  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 262 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4050  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 510 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5154  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 510 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 514 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3471  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 510 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3414  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 514 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2680  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 514 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3437  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 248 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.39912  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2565  response regulator protein  44 
 
 		 213 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000140338  decreased coverage  0.00000000000000164026 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1686  two component LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 240 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.173725  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  44.44 
 
 		 913 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0661  two component LuxR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 239 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000223942  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1620  LuxR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 287 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2837  response regulator receiver protein  36.51 
 
 		 262 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00000311945  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5023  transcriptional regulator, LuxR family  41.43 
 
 		 982 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 214 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 220 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1664  two component LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 218 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.49018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4926  regulatory protein, LuxR  41.67 
 
 		 574 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.28198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0370  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  48.5  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0618  transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 196 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03170  ATP-dependent transcriptional regulator  43.28 
 
 		 868 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1021  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.63 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.794365 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1953  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 208 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.160868  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 220 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  36.08 
 
 		 207 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4518  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 236 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4025  LuxR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 300 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0844  transcriptional regulator, LuxR family  36.07 
 
 		 234 aa  47.8  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.08 
 
 		 217 aa  47.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 799 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  41.94 
 
 		 285 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5343  LuxR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 361 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0342945 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2932  regulatory protein, LuxR  50.98 
 
 		 919 aa  48.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1700  two component LuxR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 213 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 254 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5018  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 209 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0996  ATP-dependent transcription regulator LuxR  40.98 
 
 		 930 aa  47.4  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 201 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3238  regulatory protein LuxR  44.26 
 
 		 228 aa  47.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2858  probable CsgAB operon transcriptional regulatory protein  28.99 
 
 		 215 aa  47.4  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.256874  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 225 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 216 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  39.34 
 
 		 921 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  41.46 
 
 		 894 aa  47.4  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  37.31 
 
 		 217 aa  47  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  40.32 
 
 		 216 aa  47  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 227 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1272  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 967 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.47802  normal  0.275164 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 554 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4278  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 213 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0894003 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5613  transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 238 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  38.89 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3277  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 970 aa  46.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.737282  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1611  two component LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 215 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.650425  normal  0.234442 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1536  LuxR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 357 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.413488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1543  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 204 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3030  two component LuxR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 211 aa  46.2  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0707  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 270 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2045  LuxR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 547 aa  46.2  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.62 
 
 		 208 aa  46.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000124934  normal  0.0275678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1746  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  39.06 
 
 		 204 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0260  LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 220 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2084  LuxR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 288 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4199  regulatory protein, LuxR  46.55 
 
 		 855 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0454  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 208 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.698939  hitchhiker  0.00367889 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3072  two component LuxR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.875677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0180  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 216 aa  45.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.245465  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.89 
 
 		 203 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1669  two component LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 221 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0363  PAS sensor protein  38.33 
 
 		 278 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4460  LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 486 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.478893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>