More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1620 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1620  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 287 aa  547  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4025  LuxR family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 300 aa  268  7e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.449136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4439  ATP-dependent transcription regulator LuxR  53.07 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4526  putative GAF sensor protein  53.07 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4820  putative GAF sensor protein  53.07 
 
 		 285 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2084  LuxR family transcriptional regulator  50.18 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4865  response regulator receiver protein  47.48 
 
 		 281 aa  216  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0959639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1565  response regulator receiver protein  47.9 
 
 		 281 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3743  transcriptional regulator, LuxR family  44.79 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2809  regulatory protein, LuxR  48.33 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0881  transcriptional regulator, LuxR family  43.18 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4194  LuxR family GAF modulated transcriptional regulator  41.09 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0104113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0084  regulatory protein LuxR  38.52 
 
 		 267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1536  LuxR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.413488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1543  LuxR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.24149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.9 
 
 		 228 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.82 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3373  two component LuxR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.492418  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0618  transcriptional regulator, LuxR family  46.07 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0960  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.31 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2599  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.19 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  47.54 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2811  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.1 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206772  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0939  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.224899  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  46.97 
 
 		 913 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.16538  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  43.75 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0749  transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 500 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3423  sensor protein  47.54 
 
 		 496 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5374  two component response regulator  39.74 
 
 		 779 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3120  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.02 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.954631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  44.71 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.37 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 212 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4164  LuxR transcriptional regulator  50 
 
 		 960 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950161  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3118  transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 391 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 201 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1389  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.73 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.744509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5512  two component LuxR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.631776 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5247  LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 514 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.603722  normal  0.35683 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3414  LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 514 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0278  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.68 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000789071 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2443  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 497 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.218456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2680  LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 514 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5154  LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 510 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.767005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3086  LuxR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 226 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3471  LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 510 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4050  LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 510 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4986  two component LuxR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 237 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170484  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06950  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 496 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.490761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0636  LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 496 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  31.34 
 
 		 188 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 219 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  30.95 
 
 		 261 aa  53.1  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4039  two component LuxR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 250 aa  53.1  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512873  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2409  LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 272 aa  52.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 201 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5040  LuxR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 229 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4254  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.16 
 
 		 225 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.867992  normal  0.287586 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3326  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 223 aa  52.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  46.03 
 
 		 220 aa  52.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1766  two component LuxR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 203 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00488071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.25 
 
 		 211 aa  52.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3714  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.68 
 
 		 225 aa  52.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176655 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4163  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 208 aa  52.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296115  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 231 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 231 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0670  regulatory protein, LuxR  40 
 
 		 890 aa  52.8  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 225 aa  52.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.97 
 
 		 230 aa  52.4  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 213 aa  52.4  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4323  two component LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.45 
 
 		 220 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3386  putative transcriptional regulator  40.3 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 219 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0239  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.54 
 
 		 230 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0796  LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 82 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.548535  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39980  putative transcriptional regulator  40.3 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1574  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.347453 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2093  two component LuxR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 206 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000328625  normal  0.180863 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0804  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 229 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.29 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2084  LuxR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730902  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1617  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0830  transcriptional regulator  29.23 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5022  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 947 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362862  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.45 
 
 		 226 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  31.79 
 
 		 848 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3120  response regulator receiver  32.84 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.230577  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5833  LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 489 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3277  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 224 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  49.18 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>