More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0796 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0796  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 82 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.548535  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1558  response regulator receiver  70.15 
 
 		 221 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6695  two component LuxR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3639  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.274763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0544  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2497  two component LuxR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 229 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000315398  normal  0.0281112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.43 
 
 		 225 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 222 aa  57  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3846  two component LuxR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 249 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.525033  normal  0.770826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4163  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.296115  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1682  two component LuxR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0609  response regulator receiver protein  50 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4344  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218307 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2518  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.23 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1873  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.145213  normal  0.385799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1300  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7117  two component LuxR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.26 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8800  response regulator receiver protein  50.88 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.752334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  37.88 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01320  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  43.08 
 
 		 261 aa  54.7  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3768  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28303  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.76 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 220 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 225 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0851  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 232 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08490  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  40.62 
 
 		 236 aa  53.9  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199706  normal  0.526513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2811  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206772  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0633  LuxR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  40.91 
 
 		 230 aa  53.9  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2601  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 234 aa  53.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.1212  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1617  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 214 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5633  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.6 
 
 		 203 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.603295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 202 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2352  two component LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 230 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 230 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0607  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 216 aa  53.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 208 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0341  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 216 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  43.94 
 
 		 202 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1132  DNA-binding response regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 225 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.893152  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  43.94 
 
 		 202 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1162  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 225 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.130665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7377  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 216 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0465  two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 239 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 218 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0404  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 218 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5727  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 212 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.412106 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4119  response regulator receiver  42.86 
 
 		 230 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 241 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4433  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 215 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3229  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 224 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02970  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.33 
 
 		 227 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.611463  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0560  transcriptional regulator, LuxR family protein  47.54 
 
 		 222 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3004  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 223 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0522265  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5911  two component LuxR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 219 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  43.33 
 
 		 235 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0020  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 229 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  46.43 
 
 		 889 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1393  ATP-dependent transcription regulator LuxR  45.31 
 
 		 913 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4359  transcriptional regulator, LuxR family  53.85 
 
 		 302 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1652  two component LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 217 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3768  LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 231 aa  51.6  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 230 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3409  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.68 
 
 		 221 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306896  hitchhiker  0.000114505 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1620  LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 287 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2948  response regulator receiver protein  46.27 
 
 		 221 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3591  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 240 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  hitchhiker  0.00313735 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2373  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.67 
 
 		 192 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0676  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 215 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1350  LuxR family DNA-binding response regulator  42.37 
 
 		 225 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00111586  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3200  LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 205 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 226 aa  51.2  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2391  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 239 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0696687  hitchhiker  0.00128542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0483  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.299787 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4133  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 240 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 218 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 224 aa  51.2  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.29 
 
 		 216 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  40.62 
 
 		 220 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01701  LuxR family regulatory protein  36.11 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 231 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2235  regulatory protein, LuxR  42.19 
 
 		 231 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.422182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0403  transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 		 981 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.106797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0644  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0140532  unclonable  0.00000001613 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2031  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.263481  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1264  two component LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 200 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86401 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0565  LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 239 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5114  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 230 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1523  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 215 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.0152488 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 221 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2354  two component LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 236 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5878  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.57 
 
 		 441 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.464013 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4855  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.44 
 
 		 244 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.093919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1676  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 228 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3194  LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 220 aa  50.8  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0232917  normal  0.227391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>