More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1473 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1473  putative transcriptional regulator  100 
 
 
198 aa  389  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0168255  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0491  putative transcriptional regulator  96.46 
 
 
201 aa  376  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0132873  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0516  putative transcriptional regulator  95.45 
 
 
198 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.635671  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0689  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  54.97 
 
 
200 aa  201  6e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0691  cyclic nucleotide-binding protein  37.91 
 
 
212 aa  115  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0436  transcription regulator  34.38 
 
 
214 aa  112  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0316636  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0798  transcription regulator  36.36 
 
 
213 aa  111  8.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892201  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1382  transcription regulator  35.33 
 
 
213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.69 
 
 
223 aa  108  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196856  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1312  CRP/FNR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
209 aa  105  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000433355  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1550  protein YieJ  33.51 
 
 
212 aa  105  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.31 
 
 
219 aa  98.6  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.63 
 
 
231 aa  85.9  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  27.98 
 
 
222 aa  82  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.14 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.64 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.8 
 
 
230 aa  79  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  28 
 
 
228 aa  79  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.13 
 
 
229 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  26 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
229 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
224 aa  75.1  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.4 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2845  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.85 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.76 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.61 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0906  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1296  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
218 aa  72  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00112875  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2531  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.85 
 
 
226 aa  71.2  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2104  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.91 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.02 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1171  cyclic nucleotide-binding protein  29.51 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00521884  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.05 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.37 
 
 
219 aa  68.2  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.98 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1512  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.6 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000347396  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.96 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.62 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0362  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
234 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74387  normal  0.571703 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2700  cyclic nucleotide-binding protein  23.66 
 
 
215 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00108848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2607  cyclic nucleotide-binding protein  23.66 
 
 
215 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3275  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.2 
 
 
195 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  hitchhiker  0.00943034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.5 
 
 
348 aa  63.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1256  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  23.12 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  27.12 
 
 
212 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.75 
 
 
226 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2867  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.1 
 
 
241 aa  62.8  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1531  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
239 aa  62.4  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.169257  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.61 
 
 
228 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.87 
 
 
243 aa  62  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  24.47 
 
 
236 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0324  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.11 
 
 
226 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105795  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.53 
 
 
240 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.06 
 
 
239 aa  62  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0119  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.19 
 
 
220 aa  61.6  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.701779  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0120  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.46 
 
 
231 aa  61.6  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0710  cyclic nucleotide-binding protein  25.4 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000071434  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1061  Crp family transcriptional regulator  23.5 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0336611  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.09 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1005  cyclic nucleotide-binding  21.16 
 
 
226 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.184599  normal  0.14907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.09 
 
 
222 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3189  transcriptional regulator  23.28 
 
 
236 aa  60.5  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.93 
 
 
230 aa  60.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4881  putative cyclic-AMP receptor-like protein  24.47 
 
 
281 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.139273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.93 
 
 
225 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6822  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.15 
 
 
239 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0893  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.54 
 
 
226 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1583  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.13 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.45 
 
 
222 aa  59.3  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0528  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.96 
 
 
244 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5556  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.49 
 
 
352 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.487576  normal  0.0420739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.32 
 
 
350 aa  58.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  24.47 
 
 
210 aa  58.5  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  24.47 
 
 
210 aa  58.5  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  24.47 
 
 
210 aa  58.5  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1465  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.81 
 
 
236 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.342125  normal  0.439299 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2052  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.71 
 
 
213 aa  58.5  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
247 aa  58.2  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0691  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.49 
 
 
214 aa  58.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.275069  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.45 
 
 
225 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0548  cAMP-regulatory protein  24.06 
 
 
210 aa  58.2  0.00000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.549862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.54 
 
 
222 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3202  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 
220 aa  58.2  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000322643  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  22.35 
 
 
211 aa  58.2  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4580  cAMP-regulatory protein  23.94 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0550419  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  24.47 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  23.94 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  23.4 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3032  Crp family transcriptional regulator  18.72 
 
 
224 aa  57.4  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0461942  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.14 
 
 
229 aa  57.4  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  26 
 
 
225 aa  57.4  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  22.53 
 
 
215 aa  57.4  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3141  cyclic nucleotide-binding protein  22.75 
 
 
249 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0400922  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08370  cAMP-regulatory protein  21.98 
 
 
214 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000340418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  22.53 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3066  cyclic nucleotide-binding  23.47 
 
 
240 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  23.94 
 
 
210 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>