More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0960 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  67.27 
 
 
559 aa  778    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  76.16 
 
 
557 aa  893    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  78.1 
 
 
557 aa  906    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  83.84 
 
 
557 aa  981    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  100 
 
 
557 aa  1140    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  50.18 
 
 
546 aa  559  1e-158  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  49.27 
 
 
546 aa  553  1e-156  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  49.27 
 
 
546 aa  553  1e-156  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  49.27 
 
 
546 aa  551  1e-155  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  47.61 
 
 
543 aa  535  1e-150  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  49.26 
 
 
547 aa  528  1e-148  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  46.63 
 
 
549 aa  512  1e-144  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  36.91 
 
 
604 aa  371  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  34.9 
 
 
617 aa  359  9e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  34.43 
 
 
622 aa  344  2.9999999999999997e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  34.49 
 
 
618 aa  343  4e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  33.75 
 
 
610 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  33.45 
 
 
620 aa  331  2e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  36.69 
 
 
512 aa  330  3e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  36.94 
 
 
513 aa  326  5e-88  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  34.29 
 
 
510 aa  273  7e-72  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  34.42 
 
 
547 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  31.72 
 
 
609 aa  262  1e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  36.04 
 
 
551 aa  258  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  32.38 
 
 
654 aa  258  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  32.39 
 
 
556 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  31.45 
 
 
791 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  35.45 
 
 
692 aa  253  6e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  37.63 
 
 
831 aa  253  9.000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  34.82 
 
 
847 aa  252  2e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  33.75 
 
 
545 aa  251  3e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  31.95 
 
 
797 aa  249  7e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  31.01 
 
 
682 aa  249  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  36.68 
 
 
591 aa  246  6e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  32.77 
 
 
628 aa  246  9e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  30.36 
 
 
749 aa  244  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  32.21 
 
 
640 aa  241  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  33.19 
 
 
542 aa  241  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  35.22 
 
 
549 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  36.76 
 
 
1255 aa  238  3e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  37.02 
 
 
1319 aa  236  6e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  36.52 
 
 
671 aa  236  7e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  36.62 
 
 
1335 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  35.88 
 
 
491 aa  234  3e-60  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  35.68 
 
 
991 aa  233  5e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  31.17 
 
 
558 aa  233  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  31.45 
 
 
722 aa  233  6e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  34.52 
 
 
583 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  31.09 
 
 
549 aa  232  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  34.43 
 
 
492 aa  231  3e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  33.96 
 
 
492 aa  229  1e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  31.17 
 
 
489 aa  222  9.999999999999999e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  31.27 
 
 
519 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  42.12 
 
 
612 aa  212  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  31.06 
 
 
770 aa  211  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  33.8 
 
 
577 aa  196  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  40.83 
 
 
311 aa  184  3e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  30.82 
 
 
572 aa  179  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  33.51 
 
 
438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  32.52 
 
 
440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  33.6 
 
 
440 aa  173  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  29.48 
 
 
553 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  29.48 
 
 
553 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  29.48 
 
 
553 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  29.48 
 
 
553 aa  169  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  35.74 
 
 
479 aa  167  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  35.4 
 
 
444 aa  166  9e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  32.35 
 
 
438 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  32.82 
 
 
552 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  29.93 
 
 
469 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  32.79 
 
 
447 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  33.75 
 
 
442 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  32.56 
 
 
552 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  29.69 
 
 
469 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  31.98 
 
 
454 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  32.3 
 
 
548 aa  161  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  32.52 
 
 
455 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  34.06 
 
 
463 aa  160  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  28.8 
 
 
476 aa  160  8e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  33.59 
 
 
544 aa  159  9e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  30.34 
 
 
515 aa  159  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  31.71 
 
 
446 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  32.44 
 
 
450 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  31.98 
 
 
451 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  31.98 
 
 
451 aa  158  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  36.09 
 
 
480 aa  158  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  31.98 
 
 
447 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  31.98 
 
 
447 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  36.16 
 
 
432 aa  157  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  31.98 
 
 
447 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  35.09 
 
 
452 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  34.17 
 
 
472 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  35.88 
 
 
450 aa  157  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  32.63 
 
 
463 aa  156  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  31.66 
 
 
491 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  33.97 
 
 
449 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  33.54 
 
 
473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  35.34 
 
 
412 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  30.62 
 
 
447 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  30.89 
 
 
450 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>