More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1249 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 712 aa  1459    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  46.33 
 
 		 841 aa  539  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  31.57 
 
 		 1029 aa  244  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  28.61 
 
 		 999 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  28.61 
 
 		 999 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  28.18 
 
 		 999 aa  208  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  30.22 
 
 		 1657 aa  206  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  28.46 
 
 		 972 aa  180  8e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.36 
 
 		 945 aa  164  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.02 
 
 		 396 aa  158  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.35 
 
 		 953 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.62 
 
 		 892 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.78 
 
 		 1200 aa  140  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.98 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  33.02 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  28.5 
 
 		 1132 aa  140  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  31.22 
 
 		 585 aa  140  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  31.79 
 
 		 471 aa  137  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  27.39 
 
 		 1138 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.78 
 
 		 387 aa  135  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  29.79 
 
 		 371 aa  133  9e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  31.4 
 
 		 461 aa  131  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  24.87 
 
 		 1081 aa  130  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  30.26 
 
 		 342 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.51 
 
 		 367 aa  129  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.56 
 
 		 1505 aa  128  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  36.89 
 
 		 419 aa  127  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.63 
 
 		 455 aa  127  9e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.42 
 
 		 388 aa  126  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.01 
 
 		 414 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.49 
 
 		 451 aa  123  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  30.87 
 
 		 482 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  33.03 
 
 		 400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  31.18 
 
 		 766 aa  121  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.19 
 
 		 392 aa  121  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  30.48 
 
 		 475 aa  114  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  28.21 
 
 		 394 aa  112  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.05 
 
 		 460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.79 
 
 		 388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  30.81 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.21 
 
 		 369 aa  112  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  30.56 
 
 		 676 aa  111  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.18 
 
 		 570 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.48 
 
 		 403 aa  110  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  26.84 
 
 		 918 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.75 
 
 		 442 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  25.59 
 
 		 1135 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.05 
 
 		 427 aa  107  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  31.05 
 
 		 875 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  25.17 
 
 		 1143 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  27.3 
 
 		 411 aa  105  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  27.44 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  27.44 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  24.53 
 
 		 908 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  26.67 
 
 		 2172 aa  99.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4374  glucose sorbosone dehydrogenase  30.56 
 
 		 343 aa  99  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.169886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.64 
 
 		 729 aa  98.2  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  23.94 
 
 		 1182 aa  97.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  29.5 
 
 		 381 aa  95.9  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1523  soluble aldose sugar dehydrogenase  28.44 
 
 		 369 aa  95.5  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.384739 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  28.98 
 
 		 263 aa  95.5  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  24.63 
 
 		 432 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.08 
 
 		 520 aa  95.1  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  31.39 
 
 		 518 aa  94.7  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  24.63 
 
 		 1151 aa  94.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 		 394 aa  94.4  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4365  glucose sorbosone dehydrogenase  29.24 
 
 		 381 aa  94.4  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34785  normal  0.0470149 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  26.99 
 
 		 387 aa  93.2  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  28.85 
 
 		 365 aa  93.6  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  24.93 
 
 		 378 aa  93.6  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  25.64 
 
 		 430 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  31.63 
 
 		 748 aa  92.4  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  24.49 
 
 		 428 aa  92.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  27.71 
 
 		 418 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  24.49 
 
 		 428 aa  92  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1186  glucose sorbosone dehydrogenase  26.25 
 
 		 382 aa  91.7  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8062  Quinoprotein glucose dehydrogenase  27.59 
 
 		 360 aa  92  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  25.7 
 
 		 395 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  23.82 
 
 		 941 aa  91.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  28.07 
 
 		 360 aa  90.9  7e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  34.41 
 
 		 408 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  28.35 
 
 		 385 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3557  glucose sorbosone dehydrogenase  28.14 
 
 		 374 aa  89.7  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0194162  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  27.21 
 
 		 465 aa  89  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  32.56 
 
 		 363 aa  88.2  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1271  glucose sorbosone dehydrogenase  28.47 
 
 		 368 aa  88.2  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  24.77 
 
 		 388 aa  88.6  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  25.06 
 
 		 395 aa  88.2  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1224  hypothetical protein  29.63 
 
 		 398 aa  87.8  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.303019  normal  0.552765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  23.55 
 
 		 1142 aa  87.4  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  28.83 
 
 		 388 aa  87  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2231  putative oxidoreductase  27.64 
 
 		 388 aa  87  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13844  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  32.63 
 
 		 488 aa  86.7  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0307  glucose sorbosone dehydrogenase  26.17 
 
 		 388 aa  87  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  28.9 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  28.74 
 
 		 377 aa  86.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 800 aa  86.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  30.27 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6298  hypothetical protein  27.94 
 
 		 464 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.731979 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2824  glucose sorbosone dehydrogenase  28.87 
 
 		 406 aa  86.3  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>