More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1112 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1112  competence protein E  100 
 
 		 377 aa  763    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2207  fimbrial assembly protein  47.2 
 
 		 578 aa  285  9e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000276691  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00511  putative type IV pilus biogenesis protein PilQ (cytoplasmic ATPase)  46.73 
 
 		 547 aa  272  6e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.440225  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4062  putative outer membrane porin HofQ  47.1 
 
 		 424 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000610431  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0259  putative outer membrane porin HofQ  44.55 
 
 		 433 aa  269  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0738011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0339  type IV pilus secretin PilQ  46.08 
 
 		 682 aa  266  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.201727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0224  putative outer membrane porin HofQ  46.53 
 
 		 460 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000817003  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3884  putative outer membrane porin HofQ  45.81 
 
 		 424 aa  265  7e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.366874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0337  putative outer membrane porin HofQ  42.04 
 
 		 426 aa  265  8.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4606  putative outer membrane porin HofQ  46.3 
 
 		 413 aa  265  8.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000951162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3728  putative outer membrane porin HofQ  46.53 
 
 		 500 aa  265  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000295342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3967  putative outer membrane porin HofQ  46.53 
 
 		 458 aa  265  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0667  type IV pilus secretin PilQ  45.25 
 
 		 580 aa  264  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00540746  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0237  type IV pilus secretin PilQ  45.25 
 
 		 688 aa  261  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00361408  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3369  type IV pilus biogenesis protein PilQ  43.17 
 
 		 685 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000110691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4203  type IV pilus secretin PilQ  43.35 
 
 		 683 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0392005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4085  type IV pilus secretin PilQ  43.35 
 
 		 683 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000349051  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4114  type IV pilus secretin PilQ  43.04 
 
 		 683 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000574817  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4004  type IV pilus secretin PilQ  43.35 
 
 		 683 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0761872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0162  type IV pilus secretin PilQ  45.57 
 
 		 689 aa  257  2e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0212  type IV pilus secretin PilQ  44.38 
 
 		 683 aa  257  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00466535  normal  0.0124909 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3794  outer membrane porin HofQ  43.65 
 
 		 426 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00029  type IV pilus secretin PilQ  46.06 
 
 		 583 aa  256  4e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0246  type IV pilus secretin PilQ  42.22 
 
 		 684 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0240868  normal  0.818233 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0322  outer membrane porin HofQ  44.23 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000700239  normal  0.175294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0285  type IV pilus biogenesis protein PilQ  43.35 
 
 		 684 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3587  outer membrane porin HofQ  43.65 
 
 		 412 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000785668  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3687  outer membrane porin HofQ  43.34 
 
 		 389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00260345  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3707  type IV pilus secretin PilQ  43.04 
 
 		 683 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000259618  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3699  type IV pilus secretin PilQ  42.22 
 
 		 684 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0929214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3760  outer membrane porin HofQ  43.03 
 
 		 426 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00726017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3895  type IV pilus secretin PilQ  42.22 
 
 		 684 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000037843  normal  0.221034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3861  outer membrane porin HofQ  43.65 
 
 		 412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000844499  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03243  predicted fimbrial transporter  43.65 
 
 		 412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00734996  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0322  type IV pilus secretin PilQ  43.65 
 
 		 412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000212409  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03195  hypothetical protein  43.65 
 
 		 412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0104711  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3768  outer membrane porin HofQ  43.65 
 
 		 412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000640301  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0260  type II and III secretion system protein  43.41 
 
 		 683 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0149994  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4695  outer membrane porin HofQ  43.34 
 
 		 412 aa  251  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00163721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0374  type IV pilus secretin PilQ  44.62 
 
 		 682 aa  251  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0344612  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002326  type IV pilus biogenesis protein PilQ  45.92 
 
 		 582 aa  250  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000116776  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3667  outer membrane porin HofQ  42.9 
 
 		 412 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000045876  normal  0.0733814 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0471  type IV pilus biogenesis protein PilQ  44 
 
 		 706 aa  248  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.986864  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4266  type IV pilus secretin PilQ  43.04 
 
 		 682 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.225948  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3804  outer membrane porin HofQ  41.75 
 
 		 413 aa  236  7e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0625572  normal  0.855535 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0993  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  41.07 
 
 		 698 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0962  type IV pilus (Tfp) assembly protein PilQ  41.07 
 
 		 698 aa  229  4e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1879  fimbrial assembly protein PilQ  39.88 
 
 		 756 aa  222  7e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000275793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3028  type IV pilus secretin PilQ  39.94 
 
 		 711 aa  220  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.390023  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2169  type II and III secretion system protein  37.29 
 
 		 792 aa  215  9e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.29218  normal  0.574377 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0830  type IV pilus secretin PilQ  38.94 
 
 		 704 aa  212  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0409  type II and III secretion system protein  38.92 
 
 		 692 aa  210  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714943  normal  0.127719 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1941  type IV pilus secretin PilQ  36.6 
 
 		 729 aa  209  7e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.77071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0407  type II and III secretion system protein:NolW-like:NolW-like  38.56 
 
 		 718 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2759  type IV pilus secretin PilQ  37.5 
 
 		 694 aa  205  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.354322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66620  type 4 fimbrial biogenesis outer membrane protein PilQ precursor  37.42 
 
 		 710 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.601921  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5128  type IV pilus biogenesis protein PilQ  38.99 
 
 		 718 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.981082  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5130  type IV pilus secretin PilQ  40.07 
 
 		 420 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.916141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0279  type IV pilus secretin PilQ  38.6 
 
 		 710 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.881103 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0329  fimbrial assembly protein PilQ  36.92 
 
 		 729 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0612  type II and III secretion system protein  36.23 
 
 		 668 aa  199  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0385351  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0546  type IV pilus secretin PilQ  35.12 
 
 		 706 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1785  type IV pilus secretin PilQ  35.28 
 
 		 636 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0622717  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0251  fimbrial assembly protein pilQ precursor  38.17 
 
 		 699 aa  196  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.215469  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1856  fimbrial assembly protein  35.76 
 
 		 630 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0231369  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3236  type IV pilus secretin PilQ  33.07 
 
 		 657 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0831475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0703  type IV pilus secretin PilQ  35.63 
 
 		 696 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.853833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0734  type IV pilus secretin PilQ  33.51 
 
 		 696 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0375525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5777  type 4 fimbrial biogenesis protein PilQ  36.67 
 
 		 714 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45260  secretion system protein  36.5 
 
 		 717 aa  189  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4953  type IV pilus secretin PilQ  39.21 
 
 		 420 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3403  type IV pilus secretin PilQ  35.13 
 
 		 726 aa  188  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.613607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5080  type IV pilus secretin PilQ  38.85 
 
 		 420 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0399  type IV pilus secretin PilQ  33.44 
 
 		 642 aa  184  3e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359523 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02351  fimbrial assembly protein  33.6 
 
 		 655 aa  182  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.733093  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2687  peptidase M41, FtsH  37.22 
 
 		 727 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00137304  normal  0.0272245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5577  type IV pilus secretin PilQ  36.13 
 
 		 716 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0386  type IV pilus secretin PilQ  37.59 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.591623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1000  type IV pilus secretin PilQ  33.61 
 
 		 715 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2255  type II and III secretion system protein  35.9 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.936423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1644  type IV pilus secretin PilQ  32.74 
 
 		 891 aa  178  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0838  type IV pilus secretin PilQ  35.15 
 
 		 711 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.673072  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2096  type II and III secretion system family protein  33.71 
 
 		 349 aa  176  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3131  type II and III secretion system secretin  36.64 
 
 		 706 aa  176  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2923  type II and III secretion system protein  34.99 
 
 		 710 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0018  type IV pilus secretin PilQ  32.29 
 
 		 712 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3268  type II and III secretion system protein  36.73 
 
 		 710 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0358  putative fimbrial type-4 assembly signal peptide, PilQ-like  35.38 
 
 		 567 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0621067 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1814  type IV pilus secretin PilQ  32.92 
 
 		 944 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  33.33 
 
 		 894 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3599  type IV pilus secretin PilQ  34.57 
 
 		 591 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00505018  hitchhiker  0.0000000614182 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  34.19 
 
 		 870 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2971  fimbrial type-4 assembly signal peptide protein  33.84 
 
 		 714 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0785  type II and III secretion system protein  34.74 
 
 		 717 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.113168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3205  type II/III secretion system protein  34.77 
 
 		 462 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.278596  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3701  type IV pilus secretin PilQ  34.77 
 
 		 462 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0441702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1756  type II/III secretion system protein  34.77 
 
 		 616 aa  168  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2665  type IV pilus secretin PilQ  33.76 
 
 		 926 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000377004 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2457  type II and III secretion system protein  32.11 
 
 		 723 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3759  type IV pilus secretin PilQ  35.06 
 
 		 465 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.180527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>