More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3595 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  59.32 
 
 		 849 aa  931    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  100 
 
 		 843 aa  1688    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  61.99 
 
 		 847 aa  987    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  53.96 
 
 		 839 aa  807    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  25.34 
 
 		 845 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  20.69 
 
 		 1226 aa  133  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0913  exporter-like protein  25.72 
 
 		 792 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.231192  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  25.37 
 
 		 890 aa  120  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.6 
 
 		 883 aa  119  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.26 
 
 		 886 aa  118  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.53 
 
 		 1172 aa  117  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  20.47 
 
 		 1274 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  21.14 
 
 		 1225 aa  116  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.46 
 
 		 883 aa  115  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  23.29 
 
 		 782 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  24.29 
 
 		 892 aa  109  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  24.57 
 
 		 1128 aa  109  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  18.84 
 
 		 1291 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  25.59 
 
 		 893 aa  96.3  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  22.14 
 
 		 1287 aa  96.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  28.28 
 
 		 388 aa  94  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  31.25 
 
 		 874 aa  90.1  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  35.14 
 
 		 380 aa  86.7  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  32.67 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  30.65 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  29.41 
 
 		 910 aa  85.9  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  26.91 
 
 		 972 aa  85.5  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  30.54 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.67 
 
 		 882 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4177  transmembrane protein  22.66 
 
 		 783 aa  81.6  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  19.76 
 
 		 764 aa  81.3  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2816  exporter-like protein  21.8 
 
 		 826 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249956  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004073  membrane protein inferred for ABFAE pathway  24.46 
 
 		 780 aa  78.6  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.91 
 
 		 1045 aa  78.2  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  22.96 
 
 		 864 aa  77.8  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  23.35 
 
 		 862 aa  77.8  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2683  exporter-like protein  21.48 
 
 		 826 aa  77.8  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.815942  normal  0.551153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  22.57 
 
 		 747 aa  76.6  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0941  hypothetical protein  22.09 
 
 		 784 aa  75.1  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0798  hypothetical protein  22.09 
 
 		 784 aa  75.1  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  27.67 
 
 		 861 aa  74.7  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0476  xanthomonadin exporter  22.42 
 
 		 794 aa  74.7  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1013  hypothetical protein  28.89 
 
 		 906 aa  74.3  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  26.52 
 
 		 920 aa  74.3  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  36 
 
 		 901 aa  73.9  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  22.7 
 
 		 752 aa  73.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  28.99 
 
 		 855 aa  72.8  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  30.05 
 
 		 864 aa  72.4  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1374  hypothetical protein  24.45 
 
 		 778 aa  72.4  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  25.23 
 
 		 1003 aa  71.6  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  29.94 
 
 		 1028 aa  71.6  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  31.69 
 
 		 899 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3184  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.64 
 
 		 877 aa  71.2  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  29.94 
 
 		 681 aa  71.2  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  29.94 
 
 		 1040 aa  70.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  22.96 
 
 		 1146 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  32.67 
 
 		 1022 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  32.67 
 
 		 1022 aa  70.5  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  31.82 
 
 		 879 aa  69.7  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3301  hypothetical protein  23.91 
 
 		 782 aa  70.1  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149323  normal  0.322997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2150  exporter-like  21.01 
 
 		 828 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2764  exporter-like protein  21.01 
 
 		 829 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0195609  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  20.71 
 
 		 821 aa  69.3  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0341  hypothetical protein  24.44 
 
 		 847 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.1938 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  36.27 
 
 		 901 aa  68.6  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0338  hypothetical protein  24.44 
 
 		 843 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1044  RND efflux transporter  28.79 
 
 		 858 aa  67.4  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  30.17 
 
 		 923 aa  67  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  25.7 
 
 		 1089 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0333  hypothetical protein  23.38 
 
 		 840 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0437  hypothetical protein  24.24 
 
 		 813 aa  66.2  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  30.67 
 
 		 812 aa  66.2  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  24.8 
 
 		 1013 aa  66.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0548  MMPL domain protein  31.93 
 
 		 684 aa  66.2  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0936  RND superfamily drug exporter  23.46 
 
 		 802 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2678  hypothetical protein  27.1 
 
 		 872 aa  66.2  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  26.32 
 
 		 1062 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  23.45 
 
 		 1011 aa  66.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  26.32 
 
 		 1062 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  27.7 
 
 		 905 aa  65.5  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0331  hypothetical protein  22.73 
 
 		 835 aa  65.5  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  26.47 
 
 		 788 aa  65.5  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2265  hypothetical protein  28 
 
 		 887 aa  65.1  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192256 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  24.43 
 
 		 815 aa  65.5  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0305  MMPL domain protein  21.39 
 
 		 810 aa  65.1  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  29.19 
 
 		 872 aa  64.7  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4166  putative transporter  31.72 
 
 		 908 aa  64.7  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.90663  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2674  hypothetical protein  21.72 
 
 		 802 aa  64.3  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22432  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  25.94 
 
 		 1077 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0317  MMPL domain protein  22.02 
 
 		 806 aa  64.3  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0934252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  29.91 
 
 		 862 aa  64.3  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2065  membrane protein  23.61 
 
 		 788 aa  63.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  26.18 
 
 		 1000 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.28 
 
 		 746 aa  63.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1987  membrane protein  23.67 
 
 		 788 aa  62.8  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1652  hypothetical protein  26.54 
 
 		 767 aa  62.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.485028  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.99 
 
 		 758 aa  62  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  26.41 
 
 		 709 aa  62  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  26.97 
 
 		 748 aa  61.6  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  25.46 
 
 		 1359 aa  61.6  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>