196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1213 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1213  regulatory protein TetR  100 
 
 		 216 aa  424  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0085  transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 		 219 aa  93.6  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  28.72 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 438 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  30.89 
 
 		 227 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 197 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 196 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  44.64 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  38.03 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 324 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  26.77 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  39.22 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 408 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4366  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00655225  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  42.86 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 219 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 192 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  28.5 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  27.91 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 202 aa  45.1  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 217 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 227 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 197 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 191 aa  45.1  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 197 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 197 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  38.46 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  27.01 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  33.04 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 245 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  28.74 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1702  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0140  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1789  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.461504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 424 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0147  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0158  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2712  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 335 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>