More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0606 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  100 
 
 
156 aa  326  9e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.9 
 
 
157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  53.96 
 
 
152 aa  133  9e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.67 
 
 
175 aa  120  9e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.52 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  48.55 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.77 
 
 
170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  46.48 
 
 
154 aa  114  5e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  45.03 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.22 
 
 
163 aa  108  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40 
 
 
158 aa  108  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.68 
 
 
147 aa  107  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.68 
 
 
155 aa  107  6e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  68.83 
 
 
165 aa  107  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.53 
 
 
169 aa  105  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.71 
 
 
161 aa  104  6e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.86 
 
 
171 aa  103  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  53.27 
 
 
155 aa  103  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.9 
 
 
156 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.95 
 
 
168 aa  102  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.61 
 
 
167 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.77 
 
 
167 aa  102  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.79 
 
 
165 aa  101  4e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  43.67 
 
 
164 aa  99  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  58.06 
 
 
163 aa  99  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  37.79 
 
 
169 aa  99  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.42 
 
 
157 aa  98.6  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  70.59 
 
 
193 aa  98.6  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  64.47 
 
 
79 aa  97.4  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  68.92 
 
 
163 aa  97.4  6e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  40 
 
 
174 aa  97.4  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  44.14 
 
 
155 aa  96.3  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  39.75 
 
 
165 aa  95.5  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  40.29 
 
 
172 aa  94.7  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.12 
 
 
159 aa  93.6  9e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  63.01 
 
 
168 aa  92.8  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.51 
 
 
179 aa  93.2  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  69.01 
 
 
166 aa  92.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.38 
 
 
163 aa  92.8  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  65.22 
 
 
182 aa  90.9  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.71 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.64 
 
 
172 aa  89.7  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  57.95 
 
 
172 aa  88.2  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  65.71 
 
 
152 aa  87.8  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.34 
 
 
167 aa  87.4  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.53 
 
 
171 aa  86.3  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  36.94 
 
 
158 aa  86.3  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  62.34 
 
 
171 aa  84  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.53 
 
 
167 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  49.46 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  35.76 
 
 
169 aa  81.3  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.74 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.57 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  46.23 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  80.85 
 
 
48 aa  76.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  35.29 
 
 
158 aa  71.2  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  61.4 
 
 
174 aa  70.5  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  81.82 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  40 
 
 
634 aa  68.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  51.35 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  67.27 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  39.13 
 
 
527 aa  68.6  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  41.86 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  41.86 
 
 
186 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  40 
 
 
548 aa  68.2  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  38.6 
 
 
567 aa  66.2  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.82 
 
 
174 aa  63.9  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  55 
 
 
152 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  42.05 
 
 
167 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  29.34 
 
 
174 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1300  hypothetical protein  29.79 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  36.36 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  39.33 
 
 
176 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2916  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  38.64 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.79 
 
 
121 aa  61.2  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  39.33 
 
 
176 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  40.85 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  43.06 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2680  type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  37.5 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5198  fimbrial protein pilin  36.63 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  43.66 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  45.9 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  41.03 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  43.94 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  43.94 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0852  methylation site containing protein  46.77 
 
 
131 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3170  methylation site containing protein  46.77 
 
 
131 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.25 
 
 
130 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  42.25 
 
 
130 aa  57.4  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  36.71 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1091  methylation site containing protein  41.43 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  40.58 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  40.85 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  31.93 
 
 
111 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  35.79 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  40.51 
 
 
141 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  40.28 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  52.63 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3128  methylation site containing protein  40 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.932633 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  41.03 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>