More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0148 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  100 
 
 
174 aa  357  6e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.43 
 
 
171 aa  84.3  9e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.62 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  69.39 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  66.67 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  66.67 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.15 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  67.35 
 
 
165 aa  70.5  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  31.98 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.71 
 
 
169 aa  69.7  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.35 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.71 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  62.26 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  67.35 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  33.11 
 
 
152 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.11 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  66.67 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.27 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.71 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  71.11 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  63.83 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  71.11 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  62.26 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  63.27 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  64.58 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.49 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.38 
 
 
165 aa  64.7  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  56.6 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  29.59 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.62 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  62.75 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  70.21 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.82 
 
 
156 aa  63.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.27 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.27 
 
 
155 aa  63.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  59.18 
 
 
169 aa  63.5  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  55.56 
 
 
171 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  74.36 
 
 
163 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.22 
 
 
193 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  30 
 
 
169 aa  62.4  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  54.9 
 
 
634 aa  62  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  54.9 
 
 
527 aa  62  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  56.36 
 
 
172 aa  61.6  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.9 
 
 
154 aa  60.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.86 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  75 
 
 
163 aa  59.3  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  69.05 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.18 
 
 
171 aa  59.7  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  50.94 
 
 
567 aa  59.7  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.12 
 
 
175 aa  60.1  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  59.57 
 
 
172 aa  59.3  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.18 
 
 
179 aa  58.5  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  58.14 
 
 
174 aa  58.5  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  56.86 
 
 
174 aa  58.5  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  62.22 
 
 
79 aa  58.9  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  57.14 
 
 
168 aa  58.5  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  51.02 
 
 
548 aa  57.4  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  55.32 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  62.79 
 
 
48 aa  57  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  34.09 
 
 
136 aa  56.2  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  56 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  56.52 
 
 
142 aa  55.5  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3189  fimbrial protein pilin  35.63 
 
 
162 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.208  normal  0.535395 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  52.94 
 
 
155 aa  55.1  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  48.15 
 
 
141 aa  54.7  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  45.28 
 
 
130 aa  54.7  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  47.17 
 
 
128 aa  54.3  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  46.15 
 
 
133 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  49.06 
 
 
141 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0723  type-4 fimbrial pilin-like transmembrane protein  41.51 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0720  fimbrial protein pilin  30 
 
 
133 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1088  hypothetical protein  42.03 
 
 
338 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.94 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  40.38 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3227  type IV pilus biogenesis protein PilE  51.02 
 
 
130 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  51.02 
 
 
130 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0816  type IV pilus biogenesis protein  45.76 
 
 
133 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  51.02 
 
 
130 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  46.94 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2540  fimbrial protein pilin  32.48 
 
 
140 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  51.02 
 
 
130 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  54.55 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  48.89 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  49.15 
 
 
151 aa  52.4  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  33.33 
 
 
162 aa  52  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  32.41 
 
 
179 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  37.11 
 
 
179 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  47.92 
 
 
188 aa  52  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  49.02 
 
 
152 aa  52.4  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  43.4 
 
 
167 aa  52  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  53.85 
 
 
111 aa  51.6  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  75.76 
 
 
165 aa  52  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  48.08 
 
 
141 aa  51.2  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  43.75 
 
 
164 aa  50.8  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  44.26 
 
 
169 aa  51.2  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  57.14 
 
 
182 aa  50.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  48.98 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  37.04 
 
 
147 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  56 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  68.75 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>