195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0760 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_0760  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 182 aa  358  2e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19240  2'-5' RNA ligase  49.71 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0390929 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  38.42 
 
 		 186 aa  87.4  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  34.27 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  33.15 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  27.62 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  30.68 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  30.11 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  32.57 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  31.82 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  29.55 
 
 		 176 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  28.34 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  35.11 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0857  2'-5' RNA ligase  32.77 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.358243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  25.29 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  30.16 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  32.18 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  27.81 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  27.08 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  33.88 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  24.86 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  30.27 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  30.53 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2498  2'-5' RNA ligase  25.58 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  32.62 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  33.85 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  31.34 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  28.21 
 
 		 181 aa  64.7  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  27.81 
 
 		 193 aa  64.3  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  26.32 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  32.57 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  37.78 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  30.73 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  29.57 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  27.27 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  31.15 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  25.18 
 
 		 181 aa  61.6  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  31.55 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  25.7 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3512  2'-5' RNA ligase  34.29 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0807667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  24.04 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  29.35 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  33.85 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  26.34 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  27.32 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0386  2'-5' RNA ligase, putative  35.1 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  38.95 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  24.08 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1029  2'-5' RNA ligase  30.11 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00146  2'-5' RNA ligase  33.14 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00154345  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0487  2'-5' RNA ligase  30.29 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00145  hypothetical protein  33.14 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00128631  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  31.78 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  31.78 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  22.89 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0158  2'-5' RNA ligase  33.14 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0758236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  29.46 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  29.46 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3455  2'-5' RNA ligase  33.14 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00917798  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1775  2'-5' RNA ligase  34.09 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0150  2'-5' RNA ligase  33.14 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345552  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0151  2'-5' RNA ligase  33.14 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000646366  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  32.35 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0138  2'-5' RNA ligase  33.14 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0169609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0156  2'-5' RNA ligase  33.14 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.177994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  24.61 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  30.27 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1034  2'-5' RNA ligase  31.67 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.427005  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  25.82 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  30.1 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0216  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0204  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  24.08 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  33.51 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3983  2'-5' RNA ligase  32.76 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000701591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  35.23 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  28.25 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3112  2'-5' RNA ligase  33.72 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  28.12 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0508  2'-5' RNA ligase  35.46 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170013  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  29.94 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  30.23 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0096  2'-5' RNA ligase  31.01 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  31.88 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  30.43 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  29.5 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0832  2'-5' RNA ligase  29.07 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.658836  normal  0.059604 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0222  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.367161  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0220  2'-5' RNA ligase  33.52 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0420  2'-5' RNA ligase  31.97 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0205  2'-5' RNA ligase  33.15 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  23.6 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  24.86 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0923  2',5' RNA ligase  31.54 
 
 		 177 aa  53.9  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  24.54 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5472  2'-5' RNA ligase  32.58 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0586972 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1166  2'-5' RNA ligase  32.16 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.280308  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23030  2-5 RNA ligase protein  33.72 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>