102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0508 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0508  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 192 aa  374  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.170013  hitchhiker  0.00665931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0420  2'-5' RNA ligase  71.35 
 
 		 192 aa  258  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  44.59 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  37.63 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  35.05 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  34.34 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  34.01 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  37.44 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  37.63 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19240  2'-5' RNA ligase  34.04 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0390929 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17160  2'-5' RNA ligase  33.94 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0177806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  29.67 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  33.51 
 
 		 190 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  35.46 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  32.95 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  33.15 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  29.17 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  30.87 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  36.62 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0826  2'-5' RNA ligase  31.84 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  34.27 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  33.8 
 
 		 187 aa  57  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7219  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  26.49 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  26.49 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  31.82 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1628  2'-5' RNA ligase  34 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.709746 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  26.29 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  34.69 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5825  2'-5' RNA ligase  31.32 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  31.82 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0760  2'-5' RNA ligase  32.26 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  32.67 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  35.39 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  27.98 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1320  2'-5' RNA ligase  32.88 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167347  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2113  2'-5' RNA ligase  34.44 
 
 		 168 aa  52.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0440288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  28.37 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  28.08 
 
 		 194 aa  51.6  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  34.44 
 
 		 180 aa  51.6  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  35.2 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  25.5 
 
 		 181 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  29.14 
 
 		 184 aa  51.2  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  31.47 
 
 		 186 aa  51.2  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  22.45 
 
 		 181 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  24.83 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  26.71 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  27.38 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  25.17 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  29.53 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2498  2'-5' RNA ligase  22.45 
 
 		 181 aa  50.1  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000378948  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  24.37 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1002  2'-5' RNA ligase  24.65 
 
 		 176 aa  49.3  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000523375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  33.67 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  31.48 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  25.17 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  25.17 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  25.17 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  25.17 
 
 		 181 aa  48.5  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  25.17 
 
 		 181 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  31.76 
 
 		 179 aa  47.8  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  36.36 
 
 		 184 aa  47.8  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  23.98 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3983  2'-5' RNA ligase  34.59 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000701591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  30.29 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  29.95 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  28.17 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  20.55 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  27.98 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  26.21 
 
 		 183 aa  45.4  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0386  2'-5' RNA ligase, putative  28.25 
 
 		 190 aa  45.1  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  22.6 
 
 		 189 aa  45.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1029  2'-5' RNA ligase  36.27 
 
 		 197 aa  45.1  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  30.43 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  25.52 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  29.17 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  24.67 
 
 		 173 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0904  2'-5' RNA ligase  32.1 
 
 		 271 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0022796 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1034  2'-5' RNA ligase  27.92 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.427005  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  23.94 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  29.78 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  31.35 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  22.88 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  27.27 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  24.86 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  30.28 
 
 		 180 aa  43.1  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5153  2'-5' RNA ligase  30.3 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198908  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2817  2'-5' RNA ligase  29.33 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.433451  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  30.26 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1728  2'-5' RNA ligase  29.35 
 
 		 192 aa  42  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.747406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  26.77 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  30.46 
 
 		 220 aa  41.6  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  27.93 
 
 		 200 aa  41.2  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1002  2'-5' RNA ligase  25.25 
 
 		 191 aa  41.2  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.018778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1166  2'-5' RNA ligase  32.47 
 
 		 176 aa  41.2  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.280308  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1286  2'-5' RNA ligase  31.77 
 
 		 188 aa  41.2  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.757621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>