More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0305 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_3092  MATE efflux family protein  73.39 
 
 
472 aa  661    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.755141 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0305  MATE efflux family protein  100 
 
 
467 aa  909    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  42.86 
 
 
451 aa  363  3e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  33.18 
 
 
477 aa  243  3.9999999999999997e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  34.37 
 
 
455 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  31.17 
 
 
467 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  33.49 
 
 
449 aa  223  7e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  32.21 
 
 
455 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  32.53 
 
 
455 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  32.18 
 
 
447 aa  213  7e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  31.94 
 
 
447 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  32.27 
 
 
447 aa  189  8e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  31.96 
 
 
454 aa  186  9e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  29.98 
 
 
455 aa  182  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  27.55 
 
 
448 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  27.97 
 
 
452 aa  176  9e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  32.76 
 
 
454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  29.79 
 
 
451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  31.03 
 
 
455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  27.8 
 
 
460 aa  173  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  26.61 
 
 
456 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  28.97 
 
 
460 aa  166  6.9999999999999995e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  29.98 
 
 
454 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0811  efflux protein, putative  25.27 
 
 
455 aa  163  6e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000282778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  30.56 
 
 
485 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  29.38 
 
 
451 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2307  MATE efflux family protein  28.35 
 
 
451 aa  156  7e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000873712  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  28.47 
 
 
456 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  28.61 
 
 
466 aa  154  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  24.78 
 
 
466 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  29.87 
 
 
448 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1654  MATE efflux family protein  31.98 
 
 
473 aa  152  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  27.1 
 
 
460 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  27.72 
 
 
442 aa  152  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  27.87 
 
 
464 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  27.46 
 
 
459 aa  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  26.12 
 
 
456 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  26.46 
 
 
455 aa  150  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  26.32 
 
 
452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  25.87 
 
 
439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  30.41 
 
 
449 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  27.86 
 
 
466 aa  145  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.5 
 
 
468 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  26.86 
 
 
460 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0091  MATE efflux family protein  28.26 
 
 
454 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  26.53 
 
 
460 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  27.87 
 
 
461 aa  144  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  27.73 
 
 
460 aa  143  6e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  29.32 
 
 
478 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  27.67 
 
 
493 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3482  multi anti extrusion protein MatE  27.64 
 
 
449 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456655  normal  0.0775956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  25.22 
 
 
496 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  25 
 
 
455 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  26.93 
 
 
496 aa  137  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1604  MATE efflux family protein  24.94 
 
 
450 aa  137  5e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  26.78 
 
 
466 aa  137  5e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2445  multi anti extrusion protein MatE  28.79 
 
 
443 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  25.06 
 
 
440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  25.62 
 
 
457 aa  134  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  26.77 
 
 
446 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  25.22 
 
 
442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  25.89 
 
 
462 aa  134  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  27.62 
 
 
461 aa  133  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  28.06 
 
 
458 aa  133  7.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3000  MATE efflux family protein  26.64 
 
 
458 aa  132  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.649705  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1506  MATE efflux family protein  27.64 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  25.35 
 
 
461 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  27.31 
 
 
472 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002616  multidrug resistance efflux pump  26.91 
 
 
448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  23.35 
 
 
447 aa  131  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2029  MATE efflux family protein  27.5 
 
 
455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.139982  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  25.91 
 
 
459 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2747  multi anti extrusion protein MatE  27.48 
 
 
450 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4053  multidrug efflux pump VmrA  27.02 
 
 
465 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2825  multi anti extrusion protein MatE  27.54 
 
 
450 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  24.83 
 
 
460 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0702  MATE efflux family protein  26.68 
 
 
452 aa  127  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1953  MATE efflux family protein  27.57 
 
 
454 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2923  multi anti extrusion protein MatE  27.44 
 
 
450 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  27.58 
 
 
452 aa  126  7e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  22.91 
 
 
452 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1708  MATE efflux family protein  28.67 
 
 
470 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  27.71 
 
 
451 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  26.13 
 
 
453 aa  124  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1368  multi anti extrusion protein MatE  26.54 
 
 
451 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1332  multi anti extrusion protein MatE  26.54 
 
 
451 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.478618  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  27.8 
 
 
437 aa  123  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  27.42 
 
 
440 aa  123  7e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3710  MATE efflux family protein  25.65 
 
 
455 aa  123  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  24.7 
 
 
462 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  25 
 
 
448 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3333  multi anti extrusion protein MatE  26.64 
 
 
448 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107095  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  25.22 
 
 
455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  27.8 
 
 
437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  23.67 
 
 
462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  27.17 
 
 
456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0670  MATE efflux family protein  25.43 
 
 
455 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.358402  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  26.46 
 
 
454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  26.27 
 
 
467 aa  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0643  MATE efflux family protein  25.22 
 
 
455 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>