More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1548 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  420  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  62  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  37.18 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  35.06 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 250 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5205  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.278778  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1070  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  32.69 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  43.14 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 249 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  34.07 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  31 
 
 		 239 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4699  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.310001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4101  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0039  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618128  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  30.1 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2999  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3108  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  32.86 
 
 		 253 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 258 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1313  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 231 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1884  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.543413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  38.3 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7041  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  31.09 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  25.71 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  25.71 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 232 aa  52  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  40.62 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  52  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  46.3 
 
 		 185 aa  51.6  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02063  putative transcription regulator transcription regulator protein  29.58 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495626  normal  0.936254 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4972  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 317 aa  51.6  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3421  putative transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.257842 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  34.33 
 
 		 232 aa  51.6  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  42.59 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>