75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1411 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 708 aa  1442    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 792 aa  261  4e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 827 aa  257  5e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  35.67 
 
 		 762 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0125  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 812 aa  198  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.298389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 657 aa  177  5e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0796  hypothetical protein  33.95 
 
 		 648 aa  173  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  32.91 
 
 		 657 aa  173  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  34.93 
 
 		 602 aa  171  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  31.41 
 
 		 575 aa  170  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3174  hypothetical protein  36.72 
 
 		 634 aa  167  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.676773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  30.74 
 
 		 616 aa  158  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.28 
 
 		 653 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  29.21 
 
 		 566 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 697 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0873  hypothetical protein  32.23 
 
 		 580 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.386857 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 570 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.56 
 
 		 654 aa  147  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 		 605 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  26.63 
 
 		 540 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0666  Tetratricopeptide TPR_4  29.49 
 
 		 566 aa  140  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 638 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 697 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3897  hypothetical protein  28.04 
 
 		 648 aa  127  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0795  hypothetical protein  27.96 
 
 		 650 aa  124  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.492982  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 639 aa  113  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 766 aa  99.8  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2893  hypothetical protein  26.34 
 
 		 497 aa  91.7  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0588266 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0622  hypothetical protein  27.15 
 
 		 499 aa  90.1  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130503  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0865  hypothetical protein  40.68 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.417049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 879 aa  84.3  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 534 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1658  hypothetical protein  24.29 
 
 		 579 aa  79.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000685853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.26 
 
 		 536 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 		 645 aa  76.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.65 
 
 		 699 aa  75.9  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 556 aa  75.1  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  22.8 
 
 		 759 aa  72.4  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 744 aa  70.9  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  24.27 
 
 		 460 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  25.63 
 
 		 613 aa  66.6  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2749  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.56 
 
 		 610 aa  64.3  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.56 
 
 		 610 aa  64.3  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 586 aa  63.9  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.77 
 
 		 641 aa  63.5  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 		 559 aa  63.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 		 648 aa  63.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  22.31 
 
 		 643 aa  62.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  22.57 
 
 		 582 aa  61.6  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 		 790 aa  60.8  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1641  hypothetical protein  24.09 
 
 		 572 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  23.91 
 
 		 571 aa  60.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 795 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  22.99 
 
 		 593 aa  58.9  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  24.51 
 
 		 546 aa  58.5  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  23.15 
 
 		 589 aa  58.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.49 
 
 		 576 aa  57.8  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 748 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  24.91 
 
 		 559 aa  55.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1220  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 609 aa  55.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00113386  hitchhiker  0.00622178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  25.71 
 
 		 598 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0569  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 575 aa  51.6  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0593446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6647  hypothetical protein  22.67 
 
 		 437 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  29.94 
 
 		 1914 aa  47.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0276  hypothetical protein  28.38 
 
 		 531 aa  47  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 587 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  37.97 
 
 		 825 aa  47.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0965  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 		 1084 aa  46.6  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32557  predicted protein  20.76 
 
 		 614 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  27.87 
 
 		 677 aa  45.4  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3107  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 		 219 aa  45.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 1714 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5160  hypothetical protein  26.77 
 
 		 639 aa  45.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 751 aa  44.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 1313 aa  43.9  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>