119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2312 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  100 
 
 
769 aa  1571    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  39.66 
 
 
706 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  39.14 
 
 
688 aa  180  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  30.75 
 
 
432 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1937  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  37.87 
 
 
2884 aa  160  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  35.86 
 
 
1550 aa  158  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05530  cell wall-binding protein  34.16 
 
 
1312 aa  155  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0876125  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.2 
 
 
795 aa  154  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0489  cell wall/surface repeat protein  34.63 
 
 
1452 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0529115  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2324  cell wall hydrolase/autolysin  33 
 
 
538 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000122542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4160  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.87 
 
 
326 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.08 
 
 
649 aa  147  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4728  Ig domain protein group 2 domain protein  31.97 
 
 
640 aa  147  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000565945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  34.01 
 
 
570 aa  145  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4481  Ig domain protein  32.64 
 
 
637 aa  145  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.174755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2674  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.56 
 
 
860 aa  144  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000467202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1849  Ig domain protein group 2 domain protein  30.38 
 
 
600 aa  144  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000374979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4484  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.27 
 
 
543 aa  140  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000290327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.28 
 
 
624 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.77 
 
 
619 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.417765  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3546  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.92 
 
 
510 aa  130  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.159957  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0787  VanW family protein  30.35 
 
 
600 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0348  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.26 
 
 
847 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.022722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0505  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.09 
 
 
1412 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0642654  normal  0.150071 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  33.88 
 
 
976 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8728  PKD domain containing protein  36.55 
 
 
554 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.228973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  34.43 
 
 
1916 aa  126  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0390  Putative cell wall-binding domain-like protein  29.77 
 
 
442 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.966504  normal  0.374671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3111  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.78 
 
 
885 aa  126  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57258  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  35.55 
 
 
1073 aa  124  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6568  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.66 
 
 
871 aa  125  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8843  WD40 domain protein beta Propeller  33.97 
 
 
635 aa  121  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12200  M6 family metalloprotease domain-containing protein  29.74 
 
 
1045 aa  120  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0570513  normal  0.178376 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05540  cell wall-binding protein  28.95 
 
 
962 aa  120  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8457  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.11 
 
 
905 aa  116  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0506  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.55 
 
 
448 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.225372  normal  0.064309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0728  fibronectin type III domain-containing protein  33.44 
 
 
678 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0514161  normal  0.0700786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0249  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.01 
 
 
464 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.65229  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  29.97 
 
 
626 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  31.76 
 
 
1192 aa  115  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  33.2 
 
 
258 aa  114  6e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  33.22 
 
 
998 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3899  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.42 
 
 
386 aa  113  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1722  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  33.01 
 
 
530 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0217  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.19 
 
 
684 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.952991  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8837  hypothetical protein  33.04 
 
 
673 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0484  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.48 
 
 
656 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645935  normal  0.306221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1783  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.14 
 
 
600 aa  105  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.925315  normal  0.683781 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  26.83 
 
 
404 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2236  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.5 
 
 
719 aa  103  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  28.54 
 
 
840 aa  103  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  34.69 
 
 
200 aa  103  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  26.57 
 
 
491 aa  103  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1321  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.41 
 
 
749 aa  103  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  26.71 
 
 
400 aa  103  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0216  cell wall binding repeat 2-containing protein  30.14 
 
 
663 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  30.82 
 
 
688 aa  101  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0274  hypothetical protein  31.7 
 
 
661 aa  101  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.598131  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  31.58 
 
 
1037 aa  100  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  29.02 
 
 
1131 aa  100  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  33.05 
 
 
481 aa  99.8  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  24.62 
 
 
401 aa  99.8  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8727  PKD domain containing protein  28.35 
 
 
589 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3526  PKD domain containing protein  30.63 
 
 
682 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138368  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  31.54 
 
 
841 aa  99  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8838  Putative cell wall-binding domain-like protein  28.57 
 
 
609 aa  97.8  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0161  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  32.42 
 
 
342 aa  92.4  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.635552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3709  PKD domain containing protein  29.47 
 
 
643 aa  92  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155925  normal  0.0144846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0357  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  31.02 
 
 
1059 aa  89.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2088  WD40 domain protein beta Propeller  30.55 
 
 
714 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5764  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  33.22 
 
 
635 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0700956  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14600  cell wall-binding protein  31.85 
 
 
297 aa  89.4  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.221702  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  25.68 
 
 
403 aa  87  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0218  PKD domain containing protein  27.35 
 
 
848 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.904216  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3015  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.74 
 
 
475 aa  86.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3612  fibronectin type III domain-containing protein  30.74 
 
 
667 aa  85.1  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  24.53 
 
 
528 aa  85.1  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0428  cell wall binding repeat 2-containing protein  29.44 
 
 
833 aa  85.1  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0259753  normal  0.43049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8288  Putative cell wall-binding domain-like protein  26.44 
 
 
627 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4483  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  30.22 
 
 
1135 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000331239  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1487  cell wall binding repeat 2-containing protein  31.53 
 
 
551 aa  79.7  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.470473  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  30.13 
 
 
559 aa  79.7  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  29.26 
 
 
553 aa  75.1  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  23.34 
 
 
472 aa  74.3  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  28.51 
 
 
391 aa  72  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0507  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  34.87 
 
 
600 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.427414  normal  0.0746205 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  22.3 
 
 
629 aa  69.7  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  28.51 
 
 
605 aa  64.3  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  27.83 
 
 
708 aa  62.4  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0781  putative lipoprotein  26.37 
 
 
415 aa  61.6  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0563  hypothetical protein  27.05 
 
 
415 aa  61.2  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0709  putative lipoprotein  26.37 
 
 
416 aa  60.8  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.411916 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0564  hypothetical protein  26.71 
 
 
415 aa  59.7  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  26.04 
 
 
430 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  29.29 
 
 
410 aa  58.9  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0566  putative lipoprotein  26.44 
 
 
412 aa  59.3  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  25.49 
 
 
870 aa  58.9  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  24 
 
 
940 aa  58.2  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  21.87 
 
 
408 aa  58.2  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  23.27 
 
 
378 aa  58.2  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>