More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0674 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0674  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  852    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.111926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1319  hypothetical protein  47.66 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.249275  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2846  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  34.38 
 
 		 454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0526623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1533  hypothetical protein  34.98 
 
 		 426 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2467  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  33.41 
 
 		 439 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0560  hypothetical protein  34.07 
 
 		 460 aa  224  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0528285  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1570  hypothetical protein  34.29 
 
 		 515 aa  223  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.193511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1435  hypothetical protein  34.11 
 
 		 439 aa  212  9e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0415374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3805  hypothetical protein  34.27 
 
 		 455 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000987583 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1127  hypothetical protein  31.64 
 
 		 439 aa  202  9e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2962  hypothetical protein  34.2 
 
 		 456 aa  199  5e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0301366  decreased coverage  0.0010665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4346  hypothetical protein  31.46 
 
 		 437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3717  putative DNA protecting protein DprA  33.66 
 
 		 400 aa  196  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4747  putative DNA protecting protein DprA  33.42 
 
 		 400 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.853316 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1701  DNA protecting protein DprA  32.46 
 
 		 362 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.237617  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0189  DNA processing protein DprA, putative  30.09 
 
 		 336 aa  90.1  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000738349 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0049  DNA protecting protein DprA  29.64 
 
 		 368 aa  89.7  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0496  DNA uptake Rossmann fold nucleotide-binding protein  26.75 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0547922  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1957  DNA protecting protein DprA  29.72 
 
 		 360 aa  89  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0663  DNA protecting protein DprA  31.66 
 
 		 364 aa  89  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.802271  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2471  Smf/DprA family protein  30.38 
 
 		 371 aa  87.8  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0026  DNA processing protein DprA, putative  29.37 
 
 		 362 aa  86.7  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1675  DNA protecting protein DprA  29.25 
 
 		 360 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0238407  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3792  SMF protein  29.56 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0778  DNA protecting protein DprA  32.13 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000253647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2933  DNA protecting protein DprA  28.63 
 
 		 380 aa  84.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.608648  normal  0.51398 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0212  DNA protecting protein DprA  28.63 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00622091  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4546  DNA protecting protein DprA  29.39 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0031  DNA protecting protein DprA  28.05 
 
 		 307 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0019  SMF protein  27.62 
 
 		 358 aa  80.9  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.108355 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2057  DNA protecting protein DprA  28.68 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.448378  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3673  DNA protecting protein DprA  26.92 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.917953  normal  0.236598 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0995  DNA protecting protein DprA  34.05 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1581  DNA processing protein DprA, putative  27.54 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.301322  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0077  Smf protein  29.11 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.64141  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1025  DNA processing protein DprA, putative  29.74 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00128425  unclonable  0.00000000696536 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1985  DNA protecting protein DprA  30.52 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435802  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1859  SMF protein  27.01 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1377  DNA protecting protein DprA  28.82 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2345  DNA processing protein DprA, putative  30.26 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0703  DNA processing protein DprA, putative  30.99 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.055587  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03515  Smf protein DNA processing chain A  28.31 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1396  DNA processing protein DprA, putative  32.02 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.649924  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0507  DNA protecting protein DprA  29.71 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  hitchhiker  0.00180808 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0382  DNA protecting protein DprA  28.97 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0217  SMF protein  29.53 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.396484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0698  DNA protecting protein DprA  27.13 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.194765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1222  DNA protecting protein DprA  29.52 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07520  DNA protecting protein DprA  28.44 
 
 		 409 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.891455  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_625  Rossmann fold DNA uptake nucleotide-binding protein  29.2 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4073  DNA protecting protein DprA  29.38 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4590  DNA protecting protein DprA  25.93 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0085  DNA protecting protein DprA  32.47 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.273214  normal  0.48909 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2324  DNA protecting protein DprA  27.14 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.257169  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4029  Mg chelatase, subunit ChlI  26.53 
 
 		 748 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0571  DNA protecting protein DprA  32.18 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.607235  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0088  DNA protecting protein DprA  31.41 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.226637  hitchhiker  0.00000226151 
 
 
-
 
NC_002936  DET0718  DNA processing protein DprA, putative  38.18 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.269351  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0069  DNA protecting protein DprA  31.41 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0131518  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0127  DNA processing protein DprA, putative  25.68 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0638  DNA protecting protein DprA  27.62 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0076  DNA protecting protein DprA  28.28 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0045  DNA protecting protein DprA  27.78 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1348  DNA protecting protein DprA  28.47 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0122196  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1508  DNA protecting protein DprA  26.45 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.300262 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1527  DNA protecting protein DprA  31.75 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0993227  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0085  DNA protecting protein DprA  31.85 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.182517  decreased coverage  0.00000000000000667659 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0029  DNA protecting protein DprA  29.6 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0934581 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0026  DNA protecting protein DprA  28.05 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0459  DNA protecting protein DprA  30.8 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000016133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3718  DNA protecting protein DprA  30.41 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000018591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00389  nucleotide-binding protein  32.52 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1020  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  27.62 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.274867  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0037  DNA protecting protein DprA  29.6 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000615281 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07040  DNA protecting protein DprA  25.93 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.688401  normal  0.79238 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1380  DNA protecting protein DprA  26.42 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  normal  0.326941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3717  DNA protecting protein DprA  27.42 
 
 		 374 aa  73.2  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00862167  decreased coverage  0.00279195 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0674  DNA protecting protein DprA  26.36 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035594  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0660  DNA protecting protein DprA  27.92 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.137383  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0175  DNA processing protein DprA, putative  29.44 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0031  DNA protecting protein DprA  29.6 
 
 		 338 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.912099  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3128  DNA protecting protein DprA  24.49 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328888  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3602  DNA protecting protein DprA  31.41 
 
 		 374 aa  72.4  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.62233 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0653  DNA protecting protein DprA  28.63 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.412317  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2383  DNA protecting protein DprA  28.76 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2098  DNA processing protein  29.73 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00923798  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0088  DNA protecting protein DprA  29.73 
 
 		 296 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000403325  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00190  DNA processing protein, DprA (SMF family)  30.13 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2712  DNA protecting protein DprA  27.93 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00267536  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2514  DNA processing protein DprA, putative  24.49 
 
 		 475 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2630  DNA protecting protein DprA  30.43 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3183  DNA protecting protein DprA  29.17 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1277  Rossmann fold nucleotide-binding protein for DNA uptake  26.89 
 
 		 288 aa  72  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0033  DNA protecting protein DprA  28.99 
 
 		 338 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000224726 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0281  putative SMF protein  27.54 
 
 		 365 aa  72  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3144  DNA protecting protein DprA  26.56 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0080  SMF family protein  32.22 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1433  DNA protecting protein DprA  28.17 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  0.644688 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0057  DNA protecting protein DprA  31.41 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1716  DNA protecting protein DprA  26.71 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.251857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>