More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2468 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  391  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 217 aa  71.2  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 271 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  34.86 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 220 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  33.01 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2442  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  38.03 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0836  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 470 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  42.47 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  37.14 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  34.26 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 220 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3535  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.926686  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  34.91 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  44.44 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 438 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  35.48 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  35.62 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>