More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4871 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 636 aa  1285    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.91 
 
 		 1279 aa  334  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  49.37 
 
 		 1195 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  33.5 
 
 		 782 aa  198  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 1526 aa  179  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  31.39 
 
 		 941 aa  171  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  30.79 
 
 		 985 aa  164  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  27.89 
 
 		 1060 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.65 
 
 		 991 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1238 aa  150  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.91 
 
 		 1694 aa  148  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  29.1 
 
 		 1266 aa  134  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 		 1596 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 1714 aa  127  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 412 aa  126  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  26.59 
 
 		 957 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  21.98 
 
 		 1313 aa  123  8e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  24.19 
 
 		 1914 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  23.22 
 
 		 1261 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  26.55 
 
 		 828 aa  115  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.2 
 
 		 784 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 909 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  26.22 
 
 		 1180 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2677  NB-ARC domain protein  20.85 
 
 		 788 aa  107  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0391388 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  28.2 
 
 		 2145 aa  106  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  28.42 
 
 		 1550 aa  104  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.49 
 
 		 3035 aa  104  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  31.14 
 
 		 725 aa  103  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  24.69 
 
 		 1009 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 1285 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  28.69 
 
 		 689 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.98 
 
 		 1186 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0894  TPR-related region  27.24 
 
 		 364 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179778 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  26.16 
 
 		 755 aa  99.4  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 362 aa  97.8  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 3145 aa  97.4  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 1025 aa  97.4  7e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.33 
 
 		 609 aa  97.4  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 1094 aa  96.3  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  25.53 
 
 		 1022 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 1298 aa  95.1  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  25.1 
 
 		 971 aa  95.1  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 1450 aa  95.1  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0583  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 1333 aa  94  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.204849  normal  0.7877 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 681 aa  93.6  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  24.06 
 
 		 775 aa  92  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 923 aa  91.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  24.75 
 
 		 834 aa  91.3  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.25 
 
 		 750 aa  90.9  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.97 
 
 		 764 aa  90.5  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1101 aa  90.1  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 1054 aa  90.1  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  25.56 
 
 		 1021 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 878 aa  89.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  26.39 
 
 		 809 aa  89.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.12 
 
 		 1295 aa  88.6  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 408 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2310  diguanylate cyclase  28.7 
 
 		 718 aa  89  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 1298 aa  88.2  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  23.96 
 
 		 340 aa  87.4  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 637 aa  87.4  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  22.54 
 
 		 573 aa  87  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 649 aa  86.3  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 		 4489 aa  86.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.45 
 
 		 810 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 711 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  23.78 
 
 		 343 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  23.27 
 
 		 962 aa  84.7  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3532  NB-ARC domain-containing protein  22.6 
 
 		 827 aa  85.1  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 		 1088 aa  84.7  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3010  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122789  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  27.82 
 
 		 1404 aa  84.3  0.000000000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.6 
 
 		 887 aa  84  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  24.12 
 
 		 1147 aa  84  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  28.61 
 
 		 1288 aa  83.6  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  25.53 
 
 		 833 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 949 aa  83.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 739 aa  82.8  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.92 
 
 		 3301 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  26.3 
 
 		 1040 aa  82  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  29.43 
 
 		 825 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  22.18 
 
 		 1048 aa  81.6  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  23.31 
 
 		 1054 aa  81.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5051  transcriptional regulator, SARP family  25.11 
 
 		 965 aa  80.9  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 3560 aa  80.5  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.77 
 
 		 568 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 568 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 685 aa  79.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1382  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.15 
 
 		 868 aa  79.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0126588  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.95 
 
 		 1162 aa  79.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  21.89 
 
 		 850 aa  79.7  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.3 
 
 		 3172 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 1162 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 872 aa  79  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.89 
 
 		 852 aa  78.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  25.81 
 
 		 844 aa  78.6  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 523 aa  78.6  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 750 aa  78.2  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  23.84 
 
 		 992 aa  77.4  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>