More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4994 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  100 
 
 
263 aa  517  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  41.41 
 
 
295 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  38.91 
 
 
271 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  41.41 
 
 
295 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  41.02 
 
 
295 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  41.3 
 
 
288 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  37.64 
 
 
315 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  40.87 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  41.2 
 
 
289 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  41.2 
 
 
289 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  41.2 
 
 
289 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  40.16 
 
 
321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  42.74 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  39.68 
 
 
299 aa  155  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  37.55 
 
 
277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  36.4 
 
 
273 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  36.86 
 
 
287 aa  148  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  36.88 
 
 
302 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  36.33 
 
 
296 aa  142  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  32.95 
 
 
307 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  32.95 
 
 
307 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  36.18 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  32.58 
 
 
307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  39.38 
 
 
296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  32.58 
 
 
307 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  32.58 
 
 
307 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  32.94 
 
 
294 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  34.98 
 
 
290 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  34.6 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  35.43 
 
 
292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  30.3 
 
 
281 aa  123  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  33.07 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.8 
 
 
295 aa  120  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  30.94 
 
 
279 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  29.8 
 
 
294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 
293 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  31.06 
 
 
306 aa  118  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  29.64 
 
 
293 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  32.9 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  28.17 
 
 
291 aa  115  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  27.84 
 
 
293 aa  115  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  28.02 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  29.64 
 
 
295 aa  113  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 
296 aa  113  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6462  polysaccharide deacetylase  35.08 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  30.79 
 
 
336 aa  112  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  29.41 
 
 
300 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  30.2 
 
 
293 aa  112  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  30.2 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  30.2 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  29.48 
 
 
294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  25.97 
 
 
293 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6169  polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 
302 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  35.95 
 
 
297 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  25.29 
 
 
300 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 
300 aa  98.6  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  27.14 
 
 
378 aa  95.9  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 
299 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  24.9 
 
 
319 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  30.9 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  26.58 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3612  urate catabolism protein  28.83 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253623  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4286  polysaccharide deacetylase family protein  28.83 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1582  chitin deacetylase  28.83 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.297708  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  28.38 
 
 
308 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  29.57 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.190091 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  24.66 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  26.13 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1706  polysaccharide deacetylase  27.68 
 
 
308 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.332841  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1702  polysaccharide deacetylase family protein  26.69 
 
 
366 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  28.7 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  27.03 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1881  polysaccharide deacetylase family protein  26.38 
 
 
362 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0472416  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 
292 aa  79  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3450  polysaccharide deacetylase  26.43 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21130  polysaccharide deacetylase  28.95 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1508  polysaccharide deacetylase family protein  31.88 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.324299  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  34.06 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  31.88 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3303  polysaccharide deacetylase family protein  31.88 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.248766  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2007  polysaccharide deacetylase family protein  31.88 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2388  polysaccharide deacetylase  31.88 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1279  polysaccharide deacetylase family protein  31.88 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1105  polysaccharide deacetylase family protein  25.96 
 
 
362 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.253343  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  26.69 
 
 
336 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1547  polysaccharide deacetylase family protein  25.96 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0210  polysaccharide deacetylase family protein  25.96 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152392  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  26.69 
 
 
341 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0954  polysaccharide deacetylase family protein  25.96 
 
 
366 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5684  Chitin deacetylase  26.29 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260048  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02512  hypothetical protein  24.36 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2067  polysaccharide deacetylase family protein  31.88 
 
 
317 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1728  polysaccharide deacetylase family protein  25.75 
 
 
366 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.169494  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  30.83 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  30.09 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  25.85 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1307  urate catabolism protein  30.13 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.40001  normal  0.018658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>