256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1180 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1180  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 259 aa  511  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0687091  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15120  DNA polymerase III subunit epsilon  50.88 
 
 		 228 aa  204  9e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2759  DNA polymerase III subunit epsilon  45.61 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.137424  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2481  DNA polymerase III subunit epsilon  46.38 
 
 		 236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000473559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0183  DNA polymerase III subunit epsilon  49.57 
 
 		 250 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3445  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  52.17 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0147122  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5634  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  46.02 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247829  normal  0.015317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0688  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  48.03 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.219348  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0314  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.11 
 
 		 243 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.124129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1509  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  42.79 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5735  DNA polymerase III subunit epsilon  39.08 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4959  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.81 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.865455  normal  0.183971 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08720  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  38.77 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.371322  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28650  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  44.62 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.50801 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0640  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.21 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.893813  normal  0.641508 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3054  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  43.36 
 
 		 283 aa  129  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.210781 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0468  exonuclease  26.43 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4987  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.39 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.68 
 
 		 235 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.92 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.49 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.37 
 
 		 498 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1044  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  27.57 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.69033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4419  DNA polymerase III, epsilon subunit  43.36 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  27.81 
 
 		 1433 aa  59.3  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2625  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.36 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.401759  hitchhiker  0.000000993281 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0478  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.49 
 
 		 184 aa  58.5  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1592  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  32.91 
 
 		 238 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0532  DNA polymerase III subunit epsilon  36.84 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.836516  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  26.29 
 
 		 1468 aa  57.4  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0008  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.46 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.970645  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.7 
 
 		 659 aa  57.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0439  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.17 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0424  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.26 
 
 		 186 aa  57  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2692  DNA polymerase III subunit epsilon  28.19 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  25.73 
 
 		 1635 aa  56.2  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4913  DNA polymerase III subunit epsilon  38.26 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  hitchhiker  0.00553803 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.36 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1662  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.54 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.862026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1347  DNA polymerase III epsilon subunit  28.16 
 
 		 283 aa  55.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000179804  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  25.14 
 
 		 1464 aa  55.5  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.96 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1265  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.19 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.93 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1848  DNA-directed DNA polymerase  27.14 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1255  DNA polymerase III subunit epsilon  30.43 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0108719  normal  0.264434 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0006  DNA polymerase III subunit epsilon  27.69 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0803  DNA polymerase III subunit epsilon  30.43 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1284  DNA polymerase III subunit epsilon  30.43 
 
 		 244 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000499827  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0832  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.39 
 
 		 188 aa  53.9  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0668234  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  29.51 
 
 		 1510 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0528  exonuclease  28.08 
 
 		 197 aa  53.9  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00892328  normal  0.16034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1173  DNA polymerase III subunit epsilon  31.45 
 
 		 244 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1888  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.78 
 
 		 328 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2190  DNA polymerase III subunit epsilon  32.73 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6083  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.33 
 
 		 308 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2340  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  0.684331 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1410  DNA polymerase III, epsilon subunit  38.39 
 
 		 481 aa  53.1  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.02 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  28.34 
 
 		 242 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5011  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.5 
 
 		 238 aa  52.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0113  DNA polymerase III, epsilon subunit  30 
 
 		 230 aa  52.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2053  putative PAS/PAC sensor protein  26.98 
 
 		 714 aa  52.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1161  DNA polymerase III subunit epsilon  31.45 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13583  putative DNA polymerase III epsilon chain  28 
 
 		 258 aa  52  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1010  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.65 
 
 		 236 aa  52  0.000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0343997 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.08 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4768  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.82 
 
 		 203 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.392412  hitchhiker  0.00938493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.73 
 
 		 769 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1872  DNA polymerase III subunit epsilon  33.33 
 
 		 242 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000816139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3939  DNA polymerase III subunit epsilon  26.32 
 
 		 245 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.945097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2036  DNA polymerase III subunit epsilon  29.75 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3616  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.09 
 
 		 530 aa  52  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00210343  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1452  DNA polymerase III subunit epsilon  22.22 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2090  DNA polymerase III, alpha subunit  29.82 
 
 		 1421 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.591044  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5942  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.06 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2148  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.19 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf732  DNA polymerase III PolC  27.59 
 
 		 1438 aa  52  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4643  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.93 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222434 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1567  DNA-directed DNA polymerase  27.43 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.14 
 
 		 731 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  26.67 
 
 		 1442 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  35.96 
 
 		 530 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1965  DNA polymerase III, alpha subunit  25 
 
 		 1426 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002200  DNA polymerase III epsilon subunit  27.03 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2260  DNA polymerase III subunit epsilon  25 
 
 		 299 aa  49.7  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.155641  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.49 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0501  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.68 
 
 		 238 aa  49.7  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1751  DNA polymerase III subunit epsilon  34.68 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1644  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.48 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264964  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2138  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.48 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985286 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0149  DNA polymerase III, epsilon subunit  20 
 
 		 187 aa  48.9  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1500  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.2 
 
 		 240 aa  48.9  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000153009  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.04 
 
 		 921 aa  48.9  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2125  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.73 
 
 		 203 aa  48.9  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.01 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4544  DNA polymerase III subunit epsilon  28.34 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.804755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1834  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.73 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.600995  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6889  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  38.32 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.796423  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0978  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.85 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0235504  normal  0.0652516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>