237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2481 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2481  DNA polymerase III subunit epsilon  100 
 
 		 236 aa  486  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000473559 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2759  DNA polymerase III subunit epsilon  83.69 
 
 		 254 aa  404  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.137424  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15120  DNA polymerase III subunit epsilon  52.47 
 
 		 228 aa  247  1e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1180  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  46.46 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0687091  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0314  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  43.29 
 
 		 243 aa  161  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.124129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3445  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  40.4 
 
 		 262 aa  158  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0147122  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5634  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  37.89 
 
 		 226 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247829  normal  0.015317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0183  DNA polymerase III subunit epsilon  39.22 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168499  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28650  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  43.84 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.50801 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08720  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  40 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.371322  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4959  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  40.69 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.865455  normal  0.183971 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0640  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.16 
 
 		 238 aa  149  5e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.893813  normal  0.641508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0688  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  44.5 
 
 		 247 aa  145  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.219348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1509  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.86 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3054  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  43.06 
 
 		 283 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.210781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5735  DNA polymerase III subunit epsilon  35.83 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4987  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  31.55 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13583  putative DNA polymerase III epsilon chain  31.63 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0008  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.37 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.970645  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0468  exonuclease  28.57 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3939  DNA polymerase III subunit epsilon  33.13 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.945097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3900  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.33 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.57 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4265  DNA polymerase III subunit epsilon  32.53 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5942  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.39 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0371  DNA polymerase III, alpha subunit  29.83 
 
 		 1485 aa  65.5  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.46 
 
 		 498 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1347  DNA polymerase III epsilon subunit  26.64 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000179804  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  28.31 
 
 		 1464 aa  63.2  0.000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.54 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  28.92 
 
 		 242 aa  62  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  29.28 
 
 		 1510 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1633  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.61 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.117294  hitchhiker  0.000656325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2340  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.51 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  0.684331 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  29.83 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  26.83 
 
 		 1635 aa  58.9  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2342  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.11 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.944243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0849  DNA polymerase III subunit epsilon  28.66 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  28.22 
 
 		 1397 aa  57.8  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3263  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  29.87 
 
 		 550 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  25.77 
 
 		 1433 aa  57.4  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  26.22 
 
 		 1468 aa  57  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2071  DNA polymerase III subunit epsilon  27.71 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1991  DNA polymerase III subunit epsilon  27.71 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.06 
 
 		 769 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2838  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.74 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0462127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  28.82 
 
 		 720 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.41 
 
 		 595 aa  56.2  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0024  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.59 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13734 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  25.84 
 
 		 954 aa  56.2  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.29 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2018  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.51 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250351  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3213  DNA polymerase III subunit epsilon  27.71 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2298  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.67 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.207631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.34 
 
 		 609 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.54 
 
 		 406 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.55 
 
 		 944 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1478  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.14 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  normal  0.333081 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0006  DNA polymerase III subunit epsilon  29.27 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  28.57 
 
 		 1476 aa  53.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_002620  TC0532  DNA polymerase III subunit epsilon  25.29 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.836516  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0424  DNA polymerase III, epsilon subunit  25 
 
 		 186 aa  53.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0714  exonuclease  35.77 
 
 		 516 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1384  Rad3-related DNA helicase  27.91 
 
 		 797 aa  53.5  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2362  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.23 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0173378  hitchhiker  0.0000149348 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1296  DNA polymerase III subunit epsilon  30.86 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1361  DNA polymerase III subunit epsilon  31.07 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.86 
 
 		 456 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1670  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.82 
 
 		 190 aa  53.1  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.217345  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0439  DNA polymerase III, epsilon subunit  25 
 
 		 186 aa  53.1  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1852  exonuclease  30.68 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.63 
 
 		 453 aa  52.4  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.71 
 
 		 243 aa  52.8  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2204  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.19 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000174809  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1888  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.02 
 
 		 328 aa  52  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.49 
 
 		 237 aa  52  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.76 
 
 		 449 aa  52  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1236  putative DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease  28.34 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1825  DNA polymerase III subunit epsilon  30.06 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0978  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.41 
 
 		 280 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0235504  normal  0.0652516 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2984  hypothetical protein  32.03 
 
 		 560 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2157  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.73 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000679182  normal  0.0877249 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2234  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.73 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000877394  normal  0.489263 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  27.62 
 
 		 1454 aa  51.2  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2053  putative PAS/PAC sensor protein  29.34 
 
 		 714 aa  51.6  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115114 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1880  DNA-directed DNA polymerase  31.5 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0115193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2897  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.34 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0541355  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.43 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  31.61 
 
 		 574 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2559  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.24 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  29.52 
 
 		 1444 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1381  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.17 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.348365  normal  0.0969598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  31.33 
 
 		 578 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1663  DNA polymerase III PolC  26.83 
 
 		 1449 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4339  DNA polymerase III subunit epsilon  27.47 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.12 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2958  hypothetical protein  30.95 
 
 		 617 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  31.74 
 
 		 574 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2015  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.12 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000147945  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1945  DNA polymerase III PolC  26.83 
 
 		 1449 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>