205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0314 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0314  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 		 243 aa  482  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.124129 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5634  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  50.44 
 
 		 226 aa  188  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247829  normal  0.015317 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15120  DNA polymerase III subunit epsilon  46.72 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5735  DNA polymerase III subunit epsilon  45.22 
 
 		 237 aa  185  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2759  DNA polymerase III subunit epsilon  43.91 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.137424  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2481  DNA polymerase III subunit epsilon  43.29 
 
 		 236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000473559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1180  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  48.94 
 
 		 259 aa  175  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0687091  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28650  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  45.12 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.50801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3445  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  44.44 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0147122  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0688  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  46.58 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.219348  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0640  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.88 
 
 		 238 aa  160  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.893813  normal  0.641508 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0183  DNA polymerase III subunit epsilon  42.74 
 
 		 250 aa  158  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168499  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4959  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  44.64 
 
 		 277 aa  155  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.865455  normal  0.183971 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08720  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  37.76 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.371322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1509  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  42.98 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3054  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  44.8 
 
 		 283 aa  132  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.210781 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0468  exonuclease  28.33 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4987  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.8 
 
 		 256 aa  72  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0008  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.03 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.970645  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1347  DNA polymerase III epsilon subunit  28.9 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000179804  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.48 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.77 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13583  putative DNA polymerase III epsilon chain  29.19 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.14 
 
 		 659 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  27.27 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1478  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.25 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  normal  0.333081 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0115  DNA polymerase III, epsilon subunit  30 
 
 		 239 aa  58.9  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196999  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  29.35 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  32.76 
 
 		 695 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.76 
 
 		 695 aa  58.9  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0398  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.89 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0297  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.15 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2340  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  27.04 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  0.684331 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0158  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.68 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0105  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.55 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.04 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.98 
 
 		 695 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.68 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0423  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.86 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0303  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.26 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  26.7 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3616  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.91 
 
 		 530 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00210343  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2625  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.34 
 
 		 300 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.401759  hitchhiker  0.000000993281 
 
 
-
 
NC_002620  TC0532  DNA polymerase III subunit epsilon  33.08 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.836516  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1339  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.92 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0133405  hitchhiker  0.000000000461521 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  28 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  30.12 
 
 		 1397 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2978  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.37 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2426  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.14 
 
 		 719 aa  53.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.457713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2379  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.63 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  25.81 
 
 		 1468 aa  52.8  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2183  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.86 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536096  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1831  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.82 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0849  DNA polymerase III subunit epsilon  29.89 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577786  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.72 
 
 		 235 aa  52.4  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0371  DNA polymerase III, alpha subunit  27.55 
 
 		 1485 aa  52  0.000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2284  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.63 
 
 		 240 aa  52  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3939  DNA polymerase III subunit epsilon  31.06 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.945097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.82 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2398  DNA polymerase III subunit epsilon  25.93 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5114  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.1 
 
 		 706 aa  51.6  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5011  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.59 
 
 		 238 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0006  DNA polymerase III subunit epsilon  27.4 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1251  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.48 
 
 		 228 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.56 
 
 		 921 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1888  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  28.25 
 
 		 328 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.33 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2364  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.27 
 
 		 235 aa  50.4  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2449  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.01 
 
 		 243 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365574  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1339  hypothetical protein  26.74 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1335  hypothetical protein  26.74 
 
 		 233 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1662  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.43 
 
 		 232 aa  50.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.862026 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3993  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.25 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0718563  normal  0.0295208 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3559  DNA polymerase III subunit epsilon  30.64 
 
 		 485 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1567  DNA-directed DNA polymerase  28.33 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  28.57 
 
 		 1510 aa  49.7  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2791  DNA polymerase III subunit epsilon  29.82 
 
 		 241 aa  49.7  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0063034  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1173  DNA polymerase III subunit epsilon  29.24 
 
 		 244 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  29.44 
 
 		 530 aa  49.3  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_004310  BR2071  DNA polymerase III subunit epsilon  29.07 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0113  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.09 
 
 		 230 aa  48.9  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0145  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.06 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1991  DNA polymerase III subunit epsilon  29.07 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3213  DNA polymerase III subunit epsilon  29.63 
 
 		 242 aa  48.9  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0956  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.26 
 
 		 235 aa  48.5  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2002  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.34 
 
 		 463 aa  48.5  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.891146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4544  DNA polymerase III subunit epsilon  29.47 
 
 		 235 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.804755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0501  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.11 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2288  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.81 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521561  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  33.91 
 
 		 1476 aa  48.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0930  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.61 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.41 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2209  DNA polymerase III subunit epsilon  28.65 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000456486  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2138  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.32 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985286 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3860  DNA polymerase III epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease-like protein  30.12 
 
 		 407 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0792878  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  26.67 
 
 		 1442 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0677  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.2 
 
 		 392 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1644  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.32 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0762  DNA polymerase III subunit epsilon  29.19 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869408  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2503  DNA polymerase III subunit epsilon  27.14 
 
 		 251 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>