More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0113 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0113  DNA polymerase III, epsilon subunit  100 
 
 		 230 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2838  DNA polymerase III, epsilon subunit  66.96 
 
 		 231 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0462127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2828  DNA polymerase III, epsilon subunit  65.79 
 
 		 234 aa  284  8e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.37287  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0303  DNA polymerase III, epsilon subunit  60.26 
 
 		 232 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3611  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.9 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0297  DNA polymerase III, epsilon subunit  57.2 
 
 		 231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0105  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.51 
 
 		 239 aa  248  5e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0597936 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0398  DNA polymerase III, epsilon subunit  66.67 
 
 		 231 aa  247  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0158  DNA polymerase III, epsilon subunit  56.09 
 
 		 232 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0423  DNA polymerase III, epsilon subunit  66.1 
 
 		 231 aa  244  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1251  DNA polymerase III, epsilon subunit  56.22 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.07 
 
 		 225 aa  242  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1831  DNA polymerase III, epsilon subunit  66.67 
 
 		 240 aa  240  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0389617 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0115  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.46 
 
 		 239 aa  240  1e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196999  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.75 
 
 		 236 aa  235  3e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5011  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.18 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3448  DNA polymerase III subunit epsilon  51.32 
 
 		 230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2539  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.87 
 
 		 235 aa  224  9e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.22 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  51.5 
 
 		 242 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  46.49 
 
 		 239 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3939  DNA polymerase III subunit epsilon  51.05 
 
 		 245 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.945097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1278  DNA polymerase III, epsilon subunit  52.14 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3213  DNA polymerase III subunit epsilon  50.65 
 
 		 242 aa  216  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4282  DNA polymerase III, epsilon subunit  50.21 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0555283 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2815  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.12 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.637588 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4265  DNA polymerase III subunit epsilon  46.89 
 
 		 240 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0006  DNA polymerase III subunit epsilon  49.58 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2858  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.52 
 
 		 243 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.629828  normal  0.501512 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0194  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.9 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1033  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.72 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1486  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.58 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0964346 
 
 
-
 
NC_002978  WD0108  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.64 
 
 		 231 aa  206  3e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.223432  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0849  DNA polymerase III subunit epsilon  48.05 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577786  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1763  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.44 
 
 		 236 aa  204  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.312232 
 
 
-
 
NC_004310  BR2071  DNA polymerase III subunit epsilon  49.14 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1991  DNA polymerase III subunit epsilon  49.14 
 
 		 234 aa  205  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1485  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.44 
 
 		 241 aa  204  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00650497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1533  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.81 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.159798  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2673  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.59 
 
 		 237 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.510131 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2978  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.15 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2138  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.68 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985286 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1644  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.68 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.264964  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.3 
 
 		 239 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2449  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.96 
 
 		 243 aa  198  5e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.365574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2021  DNA polymerase III, epsilon subunit  48.68 
 
 		 238 aa  197  9e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2897  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.04 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0541355  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1236  putative DNA polymerase III, epsilon subunit and related 3'-5' exonuclease  53.04 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.59 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2379  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.96 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0470  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.29 
 
 		 228 aa  195  4.0000000000000005e-49  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1592  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  54.34 
 
 		 238 aa  194  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2288  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.72 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.521561  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0867  DNA polymerase III subunit epsilon  53.76 
 
 		 249 aa  192  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.20144  normal  0.642442 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2814  DNA polymerase III, epsilon subunit  53.63 
 
 		 243 aa  192  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0839  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.3 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2148  DNA polymerase III, epsilon subunit  44.4 
 
 		 235 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.356082  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2364  DNA polymerase III, epsilon subunit  50 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2874  DNA polymerase III subunit epsilon  44.54 
 
 		 244 aa  190  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0167654  normal  0.331291 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2036  DNA polymerase III subunit epsilon  52.91 
 
 		 244 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.74 
 
 		 237 aa  187  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1161  DNA polymerase III subunit epsilon  51.74 
 
 		 244 aa  187  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1255  DNA polymerase III subunit epsilon  52.33 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0108719  normal  0.264434 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1284  DNA polymerase III subunit epsilon  52.33 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000499827  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1250  DNA polymerase III subunit epsilon  44.02 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1827  DNA polymerase III, epsilon subunit  55.49 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0803  DNA polymerase III subunit epsilon  52.33 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1027  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.19 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.134047  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1761  DNA polymerase III, epsilon chain  47.69 
 
 		 236 aa  186  2e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1339  hypothetical protein  42.04 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0720  DNA polymerase III, epsilon subunit  46.4 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.387284  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1335  hypothetical protein  42.04 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0426  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.94 
 
 		 232 aa  185  4e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.32865  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2190  DNA polymerase III subunit epsilon  50.87 
 
 		 240 aa  185  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1705  DNA polymerase III, epsilon subunit  45.18 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193811  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1173  DNA polymerase III subunit epsilon  51.16 
 
 		 244 aa  184  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  normal  0.138843 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4426  DNA polymerase III subunit epsilon  51.16 
 
 		 244 aa  184  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000436585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1495  DNA polymerase III subunit epsilon  52.3 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1272  DNA polymerase III subunit epsilon  52.3 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.337432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0762  DNA polymerase III subunit epsilon  52.3 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869408  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1599  DNA polymerase III subunit epsilon  52.3 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1465  DNA polymerase III subunit epsilon  52.3 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0555  DNA polymerase III subunit epsilon  52.3 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3993  DNA polymerase III, epsilon subunit  42.19 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0718563  normal  0.0295208 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0597  DNA polymerase III subunit epsilon  52.3 
 
 		 253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2209  DNA polymerase III subunit epsilon  50.87 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000456486  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0501  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.38 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.872409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0845  DNA polymerase III subunit epsilon  43.17 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0400  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.76 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3713  DNA polymerase III subunit epsilon  46.29 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.687255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0564  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.76 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.85 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2184  DNA polymerase III, epsilon subunit  51.45 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0859486  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0473  DNA polymerase III, epsilon subunit  47.89 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.191106  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3466  DNA polymerase III subunit epsilon  44.64 
 
 		 254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2183  DNA polymerase III, epsilon subunit  41.38 
 
 		 233 aa  181  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.536096  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1724  DNA polymerase III subunit epsilon  45.41 
 
 		 252 aa  181  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2791  DNA polymerase III subunit epsilon  50.57 
 
 		 241 aa  181  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0063034  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1478  DNA polymerase III, epsilon subunit  40.34 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  normal  0.333081 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3480  DNA polymerase III subunit epsilon  45.81 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>