232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2759 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2759  DNA polymerase III subunit epsilon  100 
 
 
254 aa  521  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.137424  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2481  DNA polymerase III subunit epsilon  83.76 
 
 
236 aa  408  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000473559 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15120  DNA polymerase III subunit epsilon  55.61 
 
 
228 aa  261  8.999999999999999e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1180  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  45.61 
 
 
259 aa  184  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0687091  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0314  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  43.15 
 
 
243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.124129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3445  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  40.71 
 
 
262 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0147122  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5634  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.82 
 
 
226 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247829  normal  0.015317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0183  DNA polymerase III subunit epsilon  38.79 
 
 
250 aa  156  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5735  DNA polymerase III subunit epsilon  40.17 
 
 
237 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0688  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.47 
 
 
247 aa  151  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.219348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1509  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.48 
 
 
295 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0640  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  36.84 
 
 
238 aa  148  8e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.893813  normal  0.641508 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28650  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  39.53 
 
 
241 aa  148  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.50801 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4959  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  40.69 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.865455  normal  0.183971 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08720  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  37.55 
 
 
238 aa  143  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.371322  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3054  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  41.28 
 
 
283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.210781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4987  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  31.58 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13583  putative DNA polymerase III epsilon chain  31.31 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0008  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.58 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.970645  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0004  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.3 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0166128  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0468  exonuclease  28.57 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2340  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.22 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal  0.684331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5942  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.9 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2765  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.55 
 
 
225 aa  67  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1633  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.73 
 
 
367 aa  64.7  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.117294  hitchhiker  0.000656325 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2342  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.67 
 
 
201 aa  63.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.944243  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3939  DNA polymerase III subunit epsilon  32.53 
 
 
245 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.945097  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3900  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.11 
 
 
269 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1670  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.15 
 
 
190 aa  62.8  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.217345  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4913  DNA polymerase III subunit epsilon  39.13 
 
 
389 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  hitchhiker  0.00553803 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1907  DNA polymerase III, epsilon subunit  33.13 
 
 
453 aa  61.2  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1888  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  31.38 
 
 
328 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  29.7 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0371  DNA polymerase III, alpha subunit  27.51 
 
 
1485 aa  60.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4265  DNA polymerase III subunit epsilon  30.49 
 
 
240 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07800  DNA polymerase III, alpha subunit  30.19 
 
 
1397 aa  60.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1911  DNA polymerase III PolC  26.95 
 
 
1468 aa  59.7  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2838  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.98 
 
 
231 aa  59.7  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0462127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0849  DNA polymerase III subunit epsilon  27.57 
 
 
231 aa  58.9  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.577786  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  28.27 
 
 
217 aa  58.5  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5011  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.73 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1347  DNA polymerase III epsilon subunit  27.05 
 
 
283 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000179804  normal  0.207247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2226  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.45 
 
 
498 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0095  DNA polymerase III PolC  26.35 
 
 
1464 aa  57.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1310  DNA polymerase III, alpha subunit  29.28 
 
 
1510 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  24.67 
 
 
954 aa  56.6  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2429  DNA polymerase III PolC  25.9 
 
 
1635 aa  57  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3386  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.34 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.328589 
 
 
-
 
NC_002620  TC0532  DNA polymerase III subunit epsilon  27.65 
 
 
232 aa  56.6  0.0000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.836516  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2298  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.2 
 
 
193 aa  56.6  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.207631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3970  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.47 
 
 
406 aa  56.2  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.126437  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3263  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  32.23 
 
 
550 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1381  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.75 
 
 
204 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.348365  normal  0.0969598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0452  DNA polymerase III PolC  25 
 
 
1433 aa  55.8  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.2678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0639  exonuclease  29.19 
 
 
215 aa  55.5  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0446468 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3213  DNA polymerase III subunit epsilon  26.15 
 
 
242 aa  55.5  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3691  hypothetical protein  28.99 
 
 
720 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1339  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.35 
 
 
201 aa  54.3  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0133405  hitchhiker  0.000000000461521 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3616  DNA polymerase III, epsilon subunit  36.84 
 
 
530 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00210343  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3336  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.07 
 
 
609 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5498  DNA polymerase III, epsilon subunit  23.86 
 
 
456 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.228182  decreased coverage  0.000256581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1680  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.55 
 
 
449 aa  53.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420679  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2362  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  26.63 
 
 
201 aa  53.5  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0173378  hitchhiker  0.0000149348 
 
 
-
 
NC_002950  PG1852  exonuclease  29.05 
 
 
259 aa  53.1  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0714  exonuclease  33.33 
 
 
516 aa  53.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0866  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.23 
 
 
204 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.183272 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0006  DNA polymerase III subunit epsilon  27.88 
 
 
236 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0866  DNA polymerase III, alpha subunit  28.73 
 
 
1476 aa  52.4  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00672697 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  27.43 
 
 
1440 aa  52.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4769  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  34.91 
 
 
590 aa  52.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.156881  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1525  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.05 
 
 
328 aa  52.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0323544  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2004  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.65 
 
 
584 aa  52.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0489491  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1292  DNA polymerase III subunit epsilon  33.94 
 
 
345 aa  52  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2137  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.49 
 
 
864 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1618  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.86 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.910547  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3922  DNA polymerase III subunit epsilon  33.56 
 
 
530 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000050364  normal  0.710356 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4339  DNA polymerase III subunit epsilon  29.61 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1834  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.58 
 
 
203 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.600995  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04615  putative DNA polymerase III alpha subunit  28.02 
 
 
1454 aa  52  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.53 
 
 
769 aa  50.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2042  DNA polymerase III PolC  28.49 
 
 
1444 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02388  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.92 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0184363  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35510  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  36.36 
 
 
611 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.77 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2204  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.35 
 
 
242 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000174809  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2682  DNA-directed DNA polymerase  31.03 
 
 
574 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.649175  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0024  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.57 
 
 
210 aa  50.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13734 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4419  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.31 
 
 
224 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.280676  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2018  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.84 
 
 
242 aa  50.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.250351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2053  putative PAS/PAC sensor protein  26.95 
 
 
714 aa  50.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.115114 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1567  DNA-directed DNA polymerase  27.81 
 
 
236 aa  50.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  30.54 
 
 
574 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  31.33 
 
 
578 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1592  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  32.37 
 
 
238 aa  49.3  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5519  DNA polymerase III subunit epsilon  33.06 
 
 
333 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.716069  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3104  hypothetical protein  29.71 
 
 
584 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1478  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.36 
 
 
231 aa  48.9  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  normal  0.333081 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.07 
 
 
595 aa  48.9  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0694  DNA polymerase III PolC  23.31 
 
 
1443 aa  48.9  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0739447  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4900  DNA polymerase III subunit epsilon  33.94 
 
 
330 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.989955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>