More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2342 on replicon NC_011667
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011667  Tmz1t_2342  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  100 
 
 
201 aa  410  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.944243  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2362  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  81.59 
 
 
201 aa  338  2.9999999999999998e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0173378  hitchhiker  0.0000149348 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2319  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  48.4 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.127163  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3499  exonuclease  47.92 
 
 
198 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108148  hitchhiker  4.31103e-25 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003462  DNA polymerase III alpha subunit (gram-positive type)  43.16 
 
 
205 aa  141  7e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02308  hypothetical protein  42.39 
 
 
217 aa  134  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0007  YacC  38.17 
 
 
282 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292935  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6889  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  42.01 
 
 
293 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.796423  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0012  DNA polymerase III fragment  34.68 
 
 
287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0181  putative exonuclease  45.37 
 
 
289 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66165  normal  0.100194 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4798  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  39.9 
 
 
330 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4217  exonuclease, RNase T and DNA polymerase III  40.35 
 
 
302 aa  96.7  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.77511  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4659  exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.03 
 
 
203 aa  94.7  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.102752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3002  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.95 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0503  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.56 
 
 
695 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0629426  normal  0.16655 
 
 
-
 
NC_002620  TC0532  DNA polymerase III subunit epsilon  31.1 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.836516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1500  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.8 
 
 
240 aa  74.7  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000153009  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2764  hypothetical protein  33.6 
 
 
120 aa  73.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1339  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.06 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0133405  hitchhiker  0.000000000461521 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0572  putative exonuclease  31.98 
 
 
695 aa  72.8  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2225  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.98 
 
 
695 aa  72.4  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.616046  normal  0.73747 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3559  DNA polymerase III subunit epsilon  34.2 
 
 
485 aa  72.4  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1099  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.5 
 
 
240 aa  71.2  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0819547  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0823  DNA polymerase III subunit epsilon  30.51 
 
 
250 aa  70.5  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.167011  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.93 
 
 
944 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0238  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.57 
 
 
731 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000829837 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1011  DNA polymerase III, alpha subunit  26.11 
 
 
1447 aa  69.3  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.939055  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4556  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.81 
 
 
659 aa  68.6  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1427  DNA polymerase III, alpha subunit  29.95 
 
 
1440 aa  68.2  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1999  DNA polymerase III domain-containing protein  30.11 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.34 
 
 
956 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3141  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.57 
 
 
595 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0498  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.28 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.231087  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2648  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.18 
 
 
769 aa  65.5  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2071  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.29 
 
 
631 aa  64.7  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4390  DNA polymerase III subunit epsilon  29.44 
 
 
578 aa  64.7  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.794868  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3482  DNA polymerase III subunit epsilon  33.61 
 
 
242 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0996  DNA polymerase III PolC  27.98 
 
 
1442 aa  64.3  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10720  hypothetical protein  26.74 
 
 
570 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.88 
 
 
952 aa  63.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2759  DNA polymerase III subunit epsilon  31.67 
 
 
254 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.137424  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0028  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.3 
 
 
237 aa  63.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1813  hypothetical protein  28.36 
 
 
603 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0953081  normal  0.0279118 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1650  DNA polymerase III PolC  24.44 
 
 
1407 aa  62.8  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00795258  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15120  DNA polymerase III subunit epsilon  31.75 
 
 
228 aa  62.4  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12219  hypothetical protein  31.61 
 
 
645 aa  62  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5104  hypothetical protein  28.72 
 
 
320 aa  62  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.547359  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16150  hypothetical protein  27.87 
 
 
584 aa  61.6  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0650546  normal  0.732328 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0780  exonuclease  30.29 
 
 
203 aa  61.6  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0352  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  25.13 
 
 
426 aa  61.6  0.000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1300  DNA polymerase III subunit epsilon  28.72 
 
 
574 aa  61.6  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0506  DNA polymerase III, epsilon subunit:DNA polymerase 3, epsilon subunit  31.3 
 
 
239 aa  61.2  0.000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.021444  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1818  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.49 
 
 
180 aa  61.2  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.562654 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3366  DNA polymerase III subunit epsilon  23.76 
 
 
315 aa  60.5  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146706  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3316  DNA polymerase III subunit epsilon  23.76 
 
 
315 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0149  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.29 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14220  hypothetical protein  29.78 
 
 
551 aa  61.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.285162  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2073  DNA polymerase III subunit epsilon  31.18 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2006  putative PAS/PAC sensor protein  30.16 
 
 
729 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.475164 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0836  conserved hypothetical protein, putative exonuclease  25.49 
 
 
459 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000965957  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1902  putative PAS/PAC sensor protein  27.32 
 
 
707 aa  60.8  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1505  putative sensor with HAMP domain  28.82 
 
 
616 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1567  DNA-directed DNA polymerase  29.95 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09513  probable DNA-directed DNA polymerase III (epsilon subunit)  26.59 
 
 
457 aa  60.1  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29590  DNA polymerase III subunit epsilon  30.77 
 
 
244 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340517  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  35.14 
 
 
921 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0603  DNA polymerase III subunit epsilon  29.5 
 
 
252 aa  60.1  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0417  DNA polymerase III, epsilon subunit  25.42 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000300495  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0194  DNA polymerase III, epsilon subunit  32.23 
 
 
231 aa  59.3  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0776  exodeoxyribonuclease X  31.61 
 
 
223 aa  59.7  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000394057  hitchhiker  0.00105392 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3622  DNA polymerase III subunit epsilon  23.2 
 
 
315 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000564162 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1991  DNA polymerase III, epsilon subunit  34.29 
 
 
243 aa  59.7  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.886511  normal  0.0774886 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1010  DNA polymerase III subunit epsilon  28.57 
 
 
244 aa  59.7  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.296834  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1242  DNA polymerase III, epsilon subunit  30 
 
 
565 aa  59.7  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3077  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.59 
 
 
383 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3711  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.91 
 
 
257 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3404  DNA polymerase III subunit epsilon  23.2 
 
 
315 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1751  DNA polymerase III subunit epsilon  30 
 
 
242 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3672  DNA polymerase III subunit epsilon  23.2 
 
 
315 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.22056  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.17 
 
 
453 aa  59.3  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3637  DNA polymerase III subunit epsilon  23.33 
 
 
315 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00085894  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3247  hypothetical protein  27.89 
 
 
601 aa  59.3  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0320196  normal  0.0964172 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1900  hypothetical protein  26.87 
 
 
590 aa  58.9  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.207393  hitchhiker  0.00000867939 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0495  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.77 
 
 
239 aa  59.3  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15750  exonuclease, DNA polymerase III, epsilon subunit family  28.65 
 
 
616 aa  58.9  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.270349  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2481  DNA polymerase III subunit epsilon  31.11 
 
 
236 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000473559 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2402  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.87 
 
 
242 aa  58.9  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000797972  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1788  exodeoxyribonuclease X  29.71 
 
 
220 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0941 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01815  exodeoxyribonuclease X  29.71 
 
 
220 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1798  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.71 
 
 
220 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3198  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.17 
 
 
236 aa  58.5  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.205342  normal  0.0244899 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01803  hypothetical protein  29.71 
 
 
220 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1342  exodeoxyribonuclease X  29.71 
 
 
220 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.214775 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1935  exodeoxyribonuclease X  29.71 
 
 
220 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1144  DNA polymerase III subunit epsilon  27.68 
 
 
245 aa  58.5  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2120  exodeoxyribonuclease X  29.71 
 
 
220 aa  58.5  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2074  exodeoxyribonuclease X  29.71 
 
 
220 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1872  DNA polymerase III subunit epsilon  30 
 
 
242 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000816139  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3051  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.65 
 
 
595 aa  58.5  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1246  exodeoxyribonuclease X  30.11 
 
 
232 aa  58.2  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.940165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>